ONT全长转录组测序是指基于ONT纳米孔测序平台进行全长转录组测序的技术。如下图所示，该技术可以通过捕获...
通过RNA测序和转录组分析,研究人员能够全面了解基因的表达情况和调控机制,从而深入研究生物体的发育、疾病机制、细胞信号传导以及环境应答等方面。本文将对RNA测序技术、转录组分析技术以及其应用领域进行探讨。 一、RNA测序技术 RNA测序技术是一种通过高通量测序,对生物样本中的RNA分子进行全面、精确的分析的技术手段。它...
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三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术,它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题,并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理: 三代全长转录组测序:三代测序技术主要包括PacBio SMRT(Single Molecule Real-Time)和Oxford Nanopore等。这些技术通过直接测序RNA...
不同样品的total RNA中mRNA含量差异较大,若total RNA起始投入量过低,不能保证有足够的mRNA用于后续建库,因此建议RNA起始量为1～4μg。 不同RIN(RNA intergrity number)示意图:(从1～10为bad to good) 由于不完整或降解的total RNA会在测序时产生3‘偏好性,因此建议RIN值≥7。
三代全长转录组测序与 RNA-seq 在技术原理和数据类型上有显著区别。RNA-seq 通常采用二代测序技术(如 Illumina),生成短序列片段,需要拼接和基因注释来重构转录本,而三代全长转录组测序使用第三代技术(如 PacBio 或 Oxford Nanopore),能够直接测序较长的 RNA 分子,获得完整的转录本。由于三代测序直接提供完整的...
转录组测序（RNA-seq）的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先，根据研究目标选择合适的策略，如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA，而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性，有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下：总RNA提取：检查纯度、浓度和完整性...
高通量测序 全转录组测序(Total RNA-Seq) 项目介绍 全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。 基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA...
子宫内膜-肌层连接处(EMJ)是连接子宫内膜和子宫肌层的纽带,对子宫腺肌病的诊断和分型具有重要意义,本研究使用单细胞RNA测序和空间图谱,绘制了在位内膜、病变和EMJ之间的转录变化图谱。在病变内,确定了独特的上皮亚群(LGR5+)、侵袭性间质(PKIB+)亚群以及WFDC1+祖细胞。此外,还观察到内皮细胞的异质性和涉及血管...
全转录组LncRNA与CircRNA测序分析策略