蛋白-蛋白活性中心预测: 1. CASTp 网址:sts.bioe.uic.edu/castp/ 网站打开缓慢,可预测蛋白活性位点。 2. ConSurf 网站:consurf.tau.ac.il/consu 有没有蛋白结构都可以,有序列也行,可预测蛋白蛋白保守位点和活性位点。 3. InterProSurf 网址:curie.utmb.edu/usercomp 预测蛋白-
蛋白质三级结构预测 1. 同源建模(SWISS-MODEL) 蛋白质结构同源模建(又称同源模拟、同源建模)的理论基础是蛋白质的三级结构比蛋白质的一级结构更为保守。 2. 折叠识别 基本原理:从蛋白质结构数据库中识别与待测序列具有相似折叠类型,进而实现对待测...
1. Hitpredict网站收集了IntAct, BIOGRID 和 HPRD数据库中的由高通量实验或者是小规模实验得到的蛋白质互作关系,综合了三大数据库的内容,数据准确全面。此外,还有根据互作得分估计的蛋白质相互作用。 2. 目前为止,网站已经收集了人类,小鼠等9个物种的蛋白质...
1. Protean3D：这是一个用于蛋白质结构预测的非常流行的网站，有一个易于使用的图形用户界面，可以使用免费的计算机资源来进行模拟。它还提供了许多有用的工具，如标准化的序列比对，位点推理等。2.I-TASSER：这是一个专为蛋白质结构预测而设计的软件包，它使用动力学模拟来模拟蛋白质的结构形态。I-TASSER可以根据...
STRING是一个蛋白质互作关系数据库,整合了多种数据源的蛋白质互作信息,包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具,用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。 12 SMART数据库 ☑️网址:smart.embl-heidelberg.de SMART是一个蛋白质结构和功能域注释数据库,提供了...
以下是蛋白质活性中心预测网站的汇总：蛋白蛋白活性中心预测网站：STS.BIOE.UIC.EDU/CASTP/ 功能：提供蛋白活性位点预测服务。特点：虽然打开速度较慢，但功能强大。CONSURF.TAU.AC.IL 功能：预测蛋白保守位点和活性位点。特点：支持结构和序列两种方式的预测。CURIE.UTMB.EDU/USERCOMP…功能：预测...
⑦STRING：STRING是一个蛋白质互作关系数据库，整合了多种数据源的蛋白质互作信息，包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具，用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。STRING: https://string-db.org/ ⑧InterPro：InterPro是一个蛋白质家族和结构域注释数据库，...
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ 这个网站针对哺乳动物蛋白中粘蛋白型GalNAc O-糖基化位点的神经网络预测。https://bip.weizmann.ac.il/index.html 这个网站是关于生物信息学和生物计算的网站，上面也有很多工具，可以帮助对蛋白质结构进行预测。好了，今天的介绍就到这里。希望能对小伙伴们有所帮助！
5、CPLM和GlyStruct：这些工具专注于蛋白质糖基化位点的预测，使用深度学习模型来提高预测精度。6、MoMe...
在过去的几十年里,人们开发了许多用于蛋白质结构预测的计算工具,其中 Phyre2 因其强大的分析能力与简单的操作被生物科研人员广泛使用,据统计每天都有约 1000 个任务提交到 Phyre2 服务器上。 Phyre2 分析能力强大,结果界面丰富直观,可以预测和分析蛋白质...