蛋白质三级结构预测 1. 同源建模(SWISS-MODEL) 蛋白质结构同源模建(又称同源模拟、同源建模)的理论基础是蛋白质的三级结构比蛋白质的一级结构更为保守。 2. 折叠识别 基本原理:从蛋白质结构数据库中识别与待测序列具有相似折叠类型,进而实现对待测...
https://scansite4.mit.edu/4.0/#home Scansite可以帮助我们预测蛋白质内部的磷酸化位点、特定结构域结合区、序列查找、蛋白质分子量等等。网站提供基本的使用教程，感兴趣的小伙伴可以浏览该网站，学习使用相关的工具。http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/ 这个网站可以进行真核蛋白中磷酸化位点神经网络预测，...
STRING是一个蛋白质互作关系数据库,整合了多种数据源的蛋白质互作信息,包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具,用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。 12 SMART数据库 ☑️网址:smart.embl-heidelberg.de SMART是一个蛋白质结构和功能域注释数据库,提供了...
蛋白质结构预测网址 下面是比较常见的蛋白质结构预测网站: 1. Protean3D:这是一个用于蛋白质结构预测的非常流行的网站,有一个易于使用的图形用户界面,可以使用免费的计算机资源来进行模拟。它还提供了许多有用的工具,如标准化的序列比对,位点推理等。 2.I-TASSER:这是一个专为蛋白质结构预测而设计的软件包,它...
⑭NCBI Conserved Domain Database (CDD)：NCBI CDD是一个蛋白质保守结构域数据库，用于识别蛋白质序列中的保守结构域和功能模块。它整合了多个结构域数据库的信息，提供了蛋白质序列的结构域注释和功能预测。NCBI Conserved Domain Database (CDD): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/ ⑮NCBI Protein Clusters...
在过去的几十年里,人们开发了许多用于蛋白质结构预测的计算工具,其中 Phyre2 因其强大的分析能力与简单的操作被生物科研人员广泛使用,据统计每天都有约 1000 个任务提交到 Phyre2 服务器上。 Phyre2 分析能力强大,结果界面丰富直观,可以预测和分析蛋白质...
由华盛顿大学贝克实验室（David Baker）开发和维护，用于蛋白质结构预测、蛋白质-蛋白质对接和新的蛋白质...
4.蛋白质亚细胞定位预测 BUSCA(http://busca.biocomp.unibo.it/) 5.预测二级结构 SOPMA (https://npsa-prabi.ibcp.fr/NPSA/npsa_sopma.html) 6.预测三级结构 SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/) I-TASSER(https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/) ...
关于预测蛋白质结构的软件或网站，当前并无一个通用解决方案。预测蛋白质三维结构的主要技术大致分为两大类：Template-free Modeling与Template Modeling。前者如Rosetta@home、Foldit与The Folding @ Home，这些工具或平台基于分布式计算，旨在预测蛋白结构，其中Rosetta@home尤为强大，由华盛顿大学贝克实验室开发...
通过比较建模预测蛋白质结构的软件有()(SWISS—MODEL网站) 正确答案 SWISS-PDBVIEWER 答案解析 略 真诚赞赏,手留余香 小额打赏 169人已赞赏