蛋白质与RNA互作是指蛋白质与RNA分子之间的相互作用。这种互作在生物体内广泛存在，参与基因表达调控、RNA加工和转运等多种生命过程。蛋白质通过与RNA结合，影响RNA的结构和功能，进而调控生物体的生理和病理过程。那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢？AlphaFold3给蛋白质与RNA互作预测提供了新的方法和工具。如遇...
RNA互作可以象征性地理解为在不同功能RNA间的交互作用,其中包括RNA-RNA相互作用和RNA-蛋白质相互作用。 1.2 RNA互作网络的应用 RNA互作网络在许多领域有广泛的应用,例如肿瘤细胞基因剪接机制研究,微生物基因表达调控分析,药物治疗药效预测,以及RNA疫苗和干扰RNA的设计和开发等。RNA互作网络特有的优势在于,可以将一个...
我们团队紧跟互作机制研究热点,可以协助您的项目,使用AlphaFold3工具进行预测分析。另外,我们团队长期聚焦互作机制研究的湿实验技术服务,如RIP-Seq互作组检测、RIP-qPCR互作蛋白验证、修饰互作验证、环境条件互作验证、互作调控机制探索等实验,协助您轻松突破互作机制
首先是二级结构,对应RNA来说,利用Vienna包中的RNAsubopt来预测RNA的二级结构,而RNAsubopt会给出若干具有最低自由能的二级结构,然后lncPro将会把这些结果转换为数字特征向量 对于蛋白质序列,同样的道理,利用Predator来预测蛋白质的二级结构,然后lncPro将会把这些结果转换为数字特征向量 而另外两个特征分别是氢键和范德华...
这个RNA与蛋白互作 不是测定分子间相互作用力吗 我们用仪器检测 亲和力大小强弱 预测的网站 不准吧~ bright8 有分子互做仪,直接测出来就好啦。 muchong5577 看看这个是否对你有帮助咯:http://swissmodel.expasy.org 根本扛不住 http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_omics_group 这个网站,比较常用的一...
这个网站，比较常用的一个RNA与蛋白质互作的网站 http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/ 这个预测特定...
专题(一)介绍转录因子与靶基因启动子、专题(二)介绍蛋白质与蛋白质的互作预测。 本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文): 优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结...
本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文): 优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合其他生信分析网站,如catRAPID、RBPDB等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的RIP...
本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文): 优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合其他生信分析网站,如catRAPID、RBPDB等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的RIP...
专题(一)介绍转录因子与靶基因启动子、专题(二)介绍蛋白质与蛋白质的互作预测。 本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文): 优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结...