可信的PPIs通常表现为在遗传研究中属于同一生物学系统、定位于同一细胞内区室,或在不同细胞类型和干扰条件下表达量高度相关。最常见的验证方法是免疫沉淀-免疫印迹法(IP-Westerns),但这种方法无法排除PPIs是否由其他蛋白或核酸介导。此外,FRET和BRET、近距离连接检测(PLA)以及生物素标记技术(如BioID和TurboID)等方法也...
因为两种蛋白质的同时纯化可能是偶然的,因此通过与已知的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)和蛋白质复合物进行比较来验证由 CF-MS 识别的 PPIs 和蛋白质复合物是非常重要的。 例如,在人类乳腺癌和非转化细胞系中通过 CF-MS 识别的 25,235 个 PPIs 中的 18,774 个以及 772 个蛋白质复合物中的 498 个得到了文献...
其中,蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)可以说是人体最重要的分子事件之一,是疾病治疗干预的重要来源。在文章工作中PPI封装了一个双视图层次:在顶视图中,蛋白质相互作用;在底视图中,关键氨基酸或残基组合形成重要的局部结构域。按照这种逻辑,生物学家通常采用分层方法来理解PPI。按照这一逻辑,生物学家经常采取分层次的方法...
蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interactions, PPIs)作为细胞生命活动的核心调控机制,在维持细胞生理功能和疾病发生发展中发挥着至关重要的作用。特别是在神经退行性疾病领域,如帕金森病(Parkinson's disease)和阿尔茨海默病(Alzheimer's disease)等,疾病相关蛋白质的异常聚集及其相互作用网络的紊乱已被证实与疾病...
利用该新型XL-MS标准,研究团队开发了Scout,一种基于人工神经网络的XL-MS数据分析搜索引擎。Scout在处理MS-可裂解交联剂生成的数据时表现出了高效和精确。Scout通过多层次的FDR过滤,在交联谱匹配(CSMs)、独特残基对(ResPairs)及蛋白质相...
该工作强调了UniBind作为问题变体的预警系统的潜力,以及其促进蛋白质相互作用研究的能力。总体而言,UniBind使用异质数据集提供了全面且高容量的蛋白质相互作用分析,有助于人类理解SARS-CoV-2的感染性和变体进化。 背景介绍 蛋白质间的相互作用(PPIs)通过其结合亲和力特征,构成了许多基础生物医学过程的核心。在微生物学和...
近日,加州大学旧金山分校 Nevan J. Krogan、多伦多大学 Jack F. Greenblatt 共同通讯在《Cell》发表综述 「Discovery and significance of protein-protein interactions in health and disease」,讨论了蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的技术发展和重要生理病理意义。
其中,蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)可以说是人体最重要的分子事件之一,是疾病治疗干预的重要来源。在文章工作中PPI封装了一个双视图层次:在顶视图中,蛋白质相互作用;在底视图中,关键氨基酸或残基组合形成重要的局部结构域。按照这种逻辑,生物学家通常采用分层方法来理解PPI。按照这一逻辑,生物学家经常采取分层次的方法...
近日,加州大学旧金山分校 Nevan J. Krogan、多伦多大学 Jack F. Greenblatt 共同通讯在《Cell》发表综述 「Discovery and significance of protein-protein interactions in health and disease」,讨论了蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的技术发展和重要生理病理意义。