本文以蛋白质-蛋白质相互作用数据为例,展示了如何使用微生信云平台在线绘制带community的分子相互作用网络图。 1,打开作图URL bioinformatics.com.cn/b 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。 示例数据包括2列: 第1列是来源(source)节点的名字 第2列是靶(target)节点的名字 第3列是相互作用的...
蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理...
2019年12月,该研究团队在Nature Methods期刊发表论文 【2】 ,开发了一种名为分子表面相互作用指纹(Molecular Surface Interaction Fingerprinting,简称MaSIF)的方法,将蛋白质表面模式翻译成数字阵列,可用于识别倾向于形成蛋白-蛋白间相互作用(PPI)的区域,以及与特定靶标互补的表面。 而在篇最新的Nature论文中,研究团队提...
蛋白质与蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）研究方法概述目前检验蛋白质之间相互作用的实验方法主要有：酵母双杂交系统（Yeast two-hybrid system）、噬菌体展示技术（Phage display）、串联亲和纯化-质谱（Tandem affinity purification-mass spectrometry, TAP-MS）以及GST pull-down。其原理与适用范围如下...
蛋白质相互作用(PPI)可以说是人体最重要的分子事件之一,事关人体生长发育、新陈代谢,是疾病治疗干预的重要来源,PPI失调会导致癌症等疾病发生,因而该领域也是医药行业关注的研究热点。 为了更好地预测和解读PPI,并深入挖掘相关分子信息,2023年3月,腾讯 AI Lab 联合香港科技大学、中国科学院大学相关团队,将深度学习领域...
蛋白质们通过蛋白质相互作用形成复合体然后进行工作。因此，研究蛋白质的相互作用成为研究蛋白质功能和作用...
蛋白质交互作用（Protein–protein interactions）PPI是指两种或以上的蛋白质结合的过程，通常旨在执行其生化...
PPI(Protein-Protein Interaction,蛋白质相互作用)探针是用于研究蛋白质之间相互作用的工具或技术。蛋白质相互作用在生物学中非常重要,因为它们决定了细胞内的信号传导、代谢途径、细胞周期调控等生命活动。PPI探针的作用是为了理解这些相互作用的本质,以及它们如何影响细胞功能和生物学过程。
一、PPI预测的原理 在理解PPI预测技术之前,我们需要了解PPI网络的概念。PPI网络是指由蛋白质组成的网络结构,其中的节点表示蛋白质,边表示蛋白质之间的相互作用。PPI预测技术的原理就是利用已知的PPI网络为基础,基于蛋白质结构、氨基酸序列等信息,进行蛋白质相互作用的预测。具体来说,预测技术可以分为基于图论、机器学习...
本文以蛋白质-蛋白质相互作用数据为例,展示了如何使用微生信云平台在线绘制带community的分子相互作用网络图。 1,打开作图URL https://www.bioinformatics.com.cn/basic_protein_protein_interaction_network_by_igraph_256 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。