ChIP 的一般流程是:甲醛固定细胞---收集细胞,将染色质复合物中 DNA 切割---加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA 复合物相互结合---加入Protein A 或 Protein G 微珠,结合抗体-靶蛋白-DNA 复合物并沉淀---对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合---洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA 复合物---解交联,纯化...
其中ChIP-Seq可以真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白,是目前研究蛋白质-DNA互作的经典方法。 一、DNA-蛋白质互作——染色质状态和功能研究 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎...
在这篇文章中,我们将介绍蛋白质与DNA互作的四种方法。 1. DNA结合蛋白 DNA结合蛋白是一类能够与DNA结合的蛋白质,它们通过与DNA的特定序列结合来调控基因表达。这些蛋白质可以通过直接与DNA结合来阻止或促进转录因子的结合,从而影响基因的表达。例如,转录因子可以通过与DNA结合来激活或抑制基因的转录,从而影响细胞的功能...
其中ChIP-Seq可以真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白,是目前研究蛋白质-DNA互作的经典方法。 一、DNA-蛋白质互作——染色质状态和功能研究 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎...
下面介绍4种常见的蛋白质与DNA互作的方法。 1. DNA结合蛋白质 DNA结合蛋白质是特殊的蛋白质,它们能够通过与DNA的特定序列结合来实现一系列的生物学功能。这种DNA结合蛋白质具有可变的DNA结合域,这些域可以根据它们所处的生物环境而发生变化,从而使它们能够识别和结合具有特定序列的DNA。这种蛋白质与DNA的相互作用可以...
真核生物基因组DNA以染色质形式存在,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达调控机制的基本途径。ChIP-seq是将染色质免疫沉淀技术(ChIP)与新一代测序技术(NGS)相结合[1],能够高效地在全基因组范围内检测与...
一、DNA-蛋白质互作——染色质状态和功能研究 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。 DNA结合蛋白是普遍存在的,在高等动植物中平均占蛋白/基因种类的10%(约2000个...
如果某种DNA分子结合上一种特殊的蛋白质,那么由于分子量的加大它在凝胶中的迁移作用便会受到阻滞,于是朝正极移动的距离也就相应的缩短,因而在凝胶中出现滞后的条带,这就是凝胶阻滞实验的基本原理。 2、过程: 1)、首先制备细胞蛋白质提取物(理论上其中含有某种特殊的转录因子) 2)、用放射性同位素标记待检测的DNA...
蛋白质-DNA互作参与了很多体内的生物学过程,弄清DNA-蛋白质相互作用的机制,对于我们了解DNA转录调控和基因表达机制,揭示各种生命活动现象具有极其重要的指导作用。 DNA-蛋白质互作研究中,根据已知什么、未知什么,分为未知DNA与未知蛋白质互作研究、已知蛋白质与未知DNA互作研究和已知DNA序列与未知蛋白质互作研究。
一、DNA-蛋白质互作——染色质状态和功能研究 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作(DNA-Protein Interactions,DPIs)是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。 DNA结合...