读文献先读图：热图怎么看？什么是热图 热图是一种以颜色的变化来表示数据矩阵或数据集中程度的图表工具。通过颜色的深浅来表示数值的大小，颜色越深表示数值越大，颜色越浅表示数值越小。在生物信息学中，热图常用于展示基因表达、蛋白质相互作用、代谢途径活性等方面的数据信息。例如，在基因表达研究中，热图可以展示...
热图(Heatmap)是一种可视化方法,用于展示规则化矩阵数据的模式、趋势和关联性。在热图中,每个单元格的值通过颜色映射转换为不同的色调,并按照一定规则填充单元格。 热图的主要用途如下: 1.可视化数据分布:热图能够直观地展示数据的分布情况。高值、低值和中间值通过不同的颜色呈现,使得人们可以迅速识别数据中的模式和...
③组合热图:多种图形组合而成的热图,用于同时展示变量在某指标的大小及变化趋势。 ④方格热图:可用于展示行列两两之间的互作关系,例如基因(配体受体)之间的互作关系。 ⑤环形热图:将环形热图与环形聚类树结合,可用于清晰展示不同分组基因的表达数据。 ⑥3D热图:通过色彩空间来展示表达量数值的高低变化。 ⑦富集分析热...
热图是一种很常见的图,其基本原则是用颜色代表数字,让数据呈现更直观、对比更明显。常用来表示不同样品组代表性基因的表达差异、不同样品组代表性化合物的含量差异、不同样品之间的两两相似性。实际上,任何一个表格数据都可以转换为热图展示。 热图基本解读 ...
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1. 关于热图的用途 热图的用途一般有两个。以RNA-seq为例,热图可以:1)直观呈现多样本多个基因的全局表达量变化;2)呈现多样本或多基因表达量的聚类关系。 第一个问题很容易理解,毕竟使用颜色(例如红绿的深浅)来展示多个样本多个基因的表达量高低,既直观又美观。
pheatmap算是大家最常用的绘制热图的R包了。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 Cloud Studio代码运行 library(pheatmap)###构建示例数据 test=matrix(rnorm(200),20,10)test[1:10,seq(1,10,2)]=test[1:10,seq(1,10,2)]+3test[11:20,seq(2,10,2)]=test[11:20,seq(2,10,2)]+2test[15...
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