非常重要的一点,添加分子标签(UMIs):在文库制备过程中,通过逆转录步骤(在PCR扩增之前)添加8 nt UMI,可以灵敏地识别PCR重复片段并校正PCR扩增错误,从而进行正确的样本数据回溯,提供更可靠的RNA-Seq分析! ■ 产品列表 Code No. 产品名称 包装量 634354 SMART-Seq® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR™ Mam...
且这一方法不受起始样本量限制,低至单细胞裂解释放的 RNA 都可以进行 rRNA 去除。 3. 当 RNA 起始量较低时,测序所需的数据量也不必过高,每个样本单独构建文库既浪费建库试剂,又增加了操作时间。本方案支持 8—24 个 cDNA 混合建库,只要将不同样本反转录得到的 cDNA 混合纯化,构建一个混合 RNA-seq 文库即可。
最早期的RNA-seq存在的严重缺点就是没有保留链特异性,这使得对基因表达水平(特别是重叠基因)进行量化变得十分具有挑战性。本研究中使用的3种产品都是链特异性的,其中Illumina TruSeq Stranded RNA文库试剂盒使用 dUTP 标记来降解第二条链;现属于IDT埃德特公司的两款RNA试剂盒都是基于Adaptase专利技术,通过仅产生一条...
产品名称:RNA-seq V2 微量或降解样本扩增试剂盒 产品型号:Nugen 7102 更新时间:2024-11-01 产品报价: 产品特点:适用于基因芯片样本的RNA扩增。 Nugen 7102RNA-seq V2 微量或降解样本扩增试剂盒的详细资料: Ovation®RNA扩增试剂盒V2提供了一种快速,简单且灵敏的方法,用于从总RNA制备扩增的cDNA用于基因表达分析...
N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine, m6A),作为RNA重要的表观修饰方式之一,在近年受到很高的重视,成为国自然的热门和CNS期刊的热点,是真核生物mRNA和lncRNA上最丰富的一种修饰,参与细胞分化、胚胎发育、环境应激和各种疾病的发生发展等过程...
近年来,笔者在科研服务中也做了成百上千例微量样本。总结来说,微量样本除了在miRNA研究上测序略胜一筹外(miRNA测序也是采用了比较特殊的建库方式),其他mRNA,lncRNA,circRNA等方面,测序是比不上芯片的。 RNA-seq建库过程比较复杂,加接头,纯化等各种操作会出现损失,根据笔者的经验,1ug的动物total RNA,进行polyA-RNA...
MeRIP-seq（Methylated RNA Immunoprecipitation，RNA 甲基化免疫共沉淀）是目前常用的m6A RNA甲基化测序技术...
典型的实验需要从研究样本中分离 RNA 并反转录成 cDNA 文库,然后进行下一代测序(NGS)和生物信息学分析。RNA-seq 文库制备方法的选择取决于几个因素,例如成本、RNA 质量和 RNA 建库起始量。高性价比的RNA微量建库方法特别令人感兴趣,因为成本、时间和材料是高通量基因表达实验中的关键限制因素。
多组学关联分析四象限图(RNA-seq与meRIP-seq) 送样要求 样本物种: 仅限人、大小鼠物种,其他物种需评估 500ng--20ug 总RNA 5x10⁶~10⁷ 细胞数量 10~20mg 组织质量 基础与高级分析 基本分析 1.测序原始reads去接头,质量控制(QC) 2.参考基因组比对(Mapping) 3.富集区域鉴定(PeakCalling) 4.富集区域注释...
研究者分别对PGC,FGSCs,GV和MII卵母细胞进行了5-8个细胞的RNA-seq,以检测不同阶段雌性生殖细胞中基因的表达情况,最终在37,980个已知小鼠基因中检测到平均17,805(47%)个基因的表达。特别是在FGSCs中,基因表达比例达到49%。为了探究这些基因表达谱是否与发育阶段相关,研究者使用非监督层次聚类算法来对RNA-seq数据...