Takara Bio特别优化推出了接头上带UMIs的全新RNA建库试剂盒SMART-Seq® Total RNA Pico Input with UMIs (ZapR™ Mammalian) ,可以针对微量的、质量差的样本构建转录组文库。 随着NGS技术的普及和推广,很多科研人都已经比较了解甚至做过转录组建库测序实验。但如果遇到RNA含量低,质量差的问题,该如何应对? 选择合适...
且这一方法不受起始样本量限制,低至单细胞裂解释放的 RNA 都可以进行 rRNA 去除。 3. 当 RNA 起始量较低时,测序所需的数据量也不必过高,每个样本单独构建文库既浪费建库试剂,又增加了操作时间。本方案支持 8—24 个 cDNA 混合建库,只要将不同样本反转录得到的 cDNA 混合纯化,构建一个混合 RNA-seq 文库即可。
为了更全面比较链特异性的RNA微量建库方法,研究人员采用由 Integrated DNA Technologies (IDT) 提供的原Swift RNA试剂盒和 Swift Rapid RNA试剂盒两款试剂盒(现已被IDT埃德特公司收购)与 Illumina TruSeq Stranded mRNA试剂盒做了系统的比较分析,研究成果发表在国际知名的Nature子刊 Scientific Reports杂志。 2021年3月,...
微量建库:只需5ng以上免疫沉淀后的DNA,即可展开测序分析; 方案灵活:根据不同的项目需求,选择不同的组蛋白修饰特异性抗体。 技术路线: 易基因提供全面的表观基因组学(DNA甲基化、DNA羟甲基化)和表观转录组学(m6A、m5C、m1A、m7G)、染色质结构与功能组学技术方案(ChIP-seq、ATAC-seq),详询易基因:0755-28317900...
【实力比拼】RNA微量建库技术哪家强?哦,原来是…… RNA 测序 (RNA-seq) 是一种常见的技术,用于分析细胞的转录组并观察基因表达的变化。典型的实验需要从研究样本中分离 RNA 并反转录成 cDNA 文库,然后进行下一代测序(NGS)和生物信息学分析。RNA-seq 文库制备方法的选择取决于几个因素,例如成本、RNA 质量和 ...
RNA 含量低,风险在于可能无法有效构建文库。这两个试剂盒可以从以下两个维度支持微量样本构建 RNA-Seq 文库! 其一,可以做到皮克级 total RNA 起始(范围支持 250 pg～10 ng 人、大/小鼠 total RNA)构建高品质文库!即使珍贵的微量临床样本,也无需过于担心样本量不足!
四、建库后的检查。 建库完成之后也不能掉以轻心,还得检查检查这个库建得好不好。可以再用一些方法检测一下库的质量,比如说看看库的浓度是不是合适,库的片段大小分布是不是符合预期等等。如果有问题,还得想办法调整,就像给房子做完装修之后要检查有没有漏洞一样。 原核RNA - Seq建库是一个比较复杂但是很有趣...
近年来,笔者在科研服务中也做了成百上千例微量样本。总结来说,微量样本除了在miRNA研究上测序略胜一筹外(miRNA测序也是采用了比较特殊的建库方式),其他mRNA,lncRNA,circRNA等方面,测序是比不上芯片的。 RNA-seq建库过程比较复杂,加接头,纯化等各种操作会出现损失,根据笔者的经验,1ug的动物total RNA,进行polyA-RNA...
相比于普通的RNA-seq文库，链特异性RNA-seq保留了转录本的方向信息，可以确定reads是来源于正链或负链，使得基因定量和可变剪切事件检测更准确，对挖掘天然反义LncRNA的信息，分析基因结构及功能分析更有利。那么有哪些方法可以实现链特异性文库构建？这些不同的方法分别适合哪类RNA样本建库呢？今天，小编将给大家进行...
2. 人和小鼠微量样本可低至2 μg RNA建库。应用场景 1. 定位m6A修饰区域，探究RNA甲基化修饰水平...