从16S rDNA测序到宏基因组【宏基因组Reads的组装与分类】Fro m 16S rD N A测序To宏基因组学研究 —宏基因组R e a d s的 组装与分类
从16S rDNA测序到宏基因组【宏基因组Reads的组装与分类】Fro m 16S rD N A测序To宏基因组学研究 —宏基因组R e a d s的 组装与分类
From 16S rDNA 测序 To 宏基因组学研究 — 宏基因组R e a d s 的 组装与分类 CONTENTS 主要内容 1 高通量测序是探索宏基因组学研究的一个工具 2 鸟枪法宏基因组微生物分类分析的计算工具 1. 高通量测序是探索宏基因组学研究的一个工具 1.1 与参考基因组进行Mapping来重构宏基因组Reads 许多微生物未被...
4.基于纳米孔测序宏基因组学研究对象是整个生境中的总dna,为了获取环境样品中完整基因组的信息,需要复原每个微生物的全长基因组序列,显然这是理想情况。但是利用宏基因组从头组装技术,即宏基因组reads首先组装成contigs,通过与参考基因组的序列比对,将分类或系统发育信息归于每个contig,得到微生物群落的物种组分,进而进...