宏基因组是指对整个生物样本或环境样本中的所有基因组进行分析研究的方法。它可以用于探索微生物、植物和动物等生物的基因组组成和功能。宏基因组分析一般包括DNA提取、建库、高通量测序等步骤,可以获得大量的基因组序列数据,并进行序列比对、功能注释、进化分析等研究。 代谢组是指对生物体内代谢物质进行全面的检测和定...
若已有目标代谢物,直接从代谢组结果中挑选目标代谢物即可;若没有目标代谢物,可以通过差异分析、KEGG富集分析、WGCNA分析等方式筛选出核心代谢物作为目标代谢物。也可以通过O2PLS模型对两个组学进行关联,通过两组间元素关联荷载图同时筛选出两个组学中重要性排名靠前的物种与代谢物。 找出目标代谢物与初步的目标物种后,...
代谢组分析结果显示,生茶与发酵后的代谢物组成有显著差异,表明发酵过程对茶叶中的代谢物组成发生了显著变化(图1A)。 代谢物差异分析结果显示,发酵后有20种代谢物的含量降低,如,表没食子儿茶素没食子酸酯、表儿茶素没食子酸酯、表没食子儿茶素、茶氨酸、山柰酚和丝氨酸;13种代谢物的含量有所增加,如,酒石酸、没...
研究者探究了微生物组是否介导了饮食干预对血糖、代谢和免疫调控的影响。通过收集每组患者中所有显著变化的特征,发现微生物在饮食干预对血糖、代谢和免疫调控的影响中起着中介作用,分类相似的物种可以发挥不同的中介作用。 4、微生物组成变化与代谢产物变化有关 根据干预前和干预后肠道微生物相对丰度,通过之前所建立的模...
研究联合利用了宏基因组与代谢组学技术，深入分析了金种子白酒中发酵谷物和窖泥微生物组成与挥发性化合物之间的相关性，揭示了核心菌群与挥发性化合物高度相关，这些发现有助于优化发酵过程、提升复合香型白酒质量，并为改进生产技术、解析发酵机制以及理解白酒发酵过程中微生物生态系统的复杂性提供了科学依据，同时结合了...
225名前糖尿病患者随机分为两组:个性化餐后葡萄糖靶向饮食(PPT)或地中海饮食(MED),在干预期间以及干预停止后两周,定时提供龈下菌斑、粪便和血清样本进行宏基因组测序和非靶代谢分析。 图1 实验设计 实验主要结果 1、不同饮食干预下微生物组的变化 通过宏基因组分析两组粪便、龈下菌斑样本。肠道微生物组中,PPT...
同时，使用DNA提取和宏基因组测序来研究两种类型谷物的微生物群落，并揭示了异味化合物与关键微生物之间的关系，以及关键异味化合物的潜在代谢途径。02 结果讨论 研究结果表明，正常发酵谷物与异味发酵谷物在感官特性和理化指标上存在显著差异。通过比较微生物群落，发现正常和异常发酵谷物之间的细菌和真菌群落结构存在显著...
粪便宏基因组学是量化肠道菌群的有利工具,具有潜在的诊断价值。而肠道代谢物如氨基酸和细菌代谢物(如胆汁酸和短链脂肪酸),也与肠道癌变相关。因此,联合宏基因组学和代谢组学对肠道环境相关变化进行关联分析可诠释CRC发展过程。日本东京工业大学Takuji Yamada科研团队对来大队列CRC样本进行了粪便宏基因组和代谢组学研究,...
代谢组:不同CRC阶段/健康,取并集得到65个差异代谢物(P < 0.005)。胆汁酸、短链脂肪酸、氨基酸和中心碳代谢物等与肠道菌群关系密切,是目前关注的焦点,关注这几类物质在不同阶段的含量变化。 相关性分析:DCA在MP中显著升高,寻找DCA显著相关的菌属-B. wadsworthia(Spearman相关性分析)。由于a . parvulum在MP和S0中...
组学技术：多样性+宏基因组+代谢组 肠道菌群在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的进展中发挥重要作用，但具体机制尚未明确。本文就此进行了深入探究。主要结果：①研究通过开发一种基于点击化学的富集策略，发现了几种微生物来源的胆汁酸，包括之前未确定特征的3-琥珀酰胆酸(3-sucCA)，该胆汁酸与肝组织活检证实的...