海马样本中的snRNA-seq、real-time PCR和免疫荧光分析表明,ips-iACS和bi-iACS在增加海马神经元数量方面非常有效。而con-iACS对神经元增加没有表现出显着影响。此外,与在皮层中的观察类似,没有一个iACS方案显示出对海马体神经胶质细胞的显着影响(图2I-J, 图3E-H)。丘脑中通过snRNA-seq、real-time PCR和免疫...
将解离的rESCs在rEpiLCs培养基中培养48-72h以形成聚集体，这些聚集体被转移到含有BMP4（一种对PGC命运至关重要的细胞因子【7】）的PGCLCs培养基中继续培养。通过RNA-seq分析第3天（d3）rPGCLCs的转录组，将其与rESCs、rEpiLCs、体内大鼠外胚层和rPGCs进行比较，d3 rPGCLCs表达了PGCs中包含的所有标志物和多能...
图3 差异表达基因的生物信息学分析根据评分结果和DEGs的生物学功能，本研究中选择了几个参与免疫应答、癌症应答、氧化应激应答和DNA损伤应答的基因成员进行RT-qPCR验证。RNA-seq检测和qPCR检测的基因表达水平趋势一致（图4）。图4 RT-qPCR验证mRNA-seq结果 实验结论 综合结果表明，一些金属元素(Mn、Zn、Co、Ni)和稀...
根据评分结果和DEGs的生物学功能,本研究中选择了几个参与免疫应答、癌症应答、氧化应激应答和DNA损伤应答的基因成员进行RT-qPCR验证。RNA-seq检测和qPCR检测的基因表达水平趋势一致(图4)。 图4 RT-qPCR验证mRNA-seq结果 实验结论 综合结果表明,一些金属元素(Mn、Zn、Co、Ni)和稀土元素 (Sc、Nb、La、Ce、Pr、Dy...
看到这套数据没有人用感觉好心痛哈,宣传一下,首先这套数据的文章发表在Frontiers in Genetics,文章标题 Integrative analysis of Iso-Seq and RNA-seq reveals dynamic changes of alternative promoter, alter…
本研究采用RNA‑seq技术分析氯胺酮麻醉对大鼠大脑皮质中mRNA表达的影响,识别显著上调/下调基因并进行基因功能分析,为探索氯胺酮诱导麻醉的潜在机制提供了方向。 本研究中差异基因功能主要集中在翻译、光传导、神经突触功能、物质代谢和免疫等方面,如5‑羟色胺能突触。研究表明,使用5‑羟色胺受体拮抗剂可以增强氯胺酮...
在RNA-Seq结果中,通过Reactome富集到IL-12和IL-23炎症因子信号通路,它们驱动慢性肠道上皮屏障缺陷[28]。而我们在LPS组肠道中同时富集到IL-12和IL-23,提示LPS组子代大鼠可能存在慢性肠道炎症,与IgA的结果提示一致。通过GO_BP富集到神经...
大鼠脑组织单细胞核测序(Single-Nucleus RNA Sequencing, snRNA-seq)可以揭示大鼠脑组织中不同细胞类型的转录组特征,进而构建细胞族谱(Cellular Taxonomy)。 细胞族谱是指在生物体中,根据细胞的形态、结构、功能等特征,将细胞划分为不同的家族或集合的过程。通过snRNA-seq,我们可以在单细胞水平上检测不同细胞类型的基...
长非编码RNA建库主要采用ribozero kit去除rRNA,根据客户需求建链特异性文库or普通文库。 3. 为什么要去rRNA? RNA测序其实想得到的是mRNA和lncRNA的信息,但是总RNA当中绝大部分都是rRNA,这些RNA的信息是无用的,所以需要去掉。 4. 什么是链特异性文库? 链特异性文库是在RNA-seq文库构建时,经过简单处理,在合成第二...
取各组大鼠外周血进行白细胞数量检测;采用Illumina测序平台进行RNA-seq,筛选差异基因,结合GO与KEGG数据库,对差异基因进行生物信息学相关分析。 结果与结论:①与空白组比较,模型组白细胞数量显著减少(P < 0.001)。②RNA-seq共筛选出模型组与空白组间差异基因3 026个,其中...