图3 差异表达基因的生物信息学分析根据评分结果和DEGs的生物学功能，本研究中选择了几个参与免疫应答、癌症应答、氧化应激应答和DNA损伤应答的基因成员进行RT-qPCR验证。RNA-seq检测和qPCR检测的基因表达水平趋势一致（图4）。图4 RT-qPCR验证mRNA-seq结果 实验结论 综合结果表明，一些金属元素(Mn、Zn、Co、Ni)和稀...
看到这套数据没有人用感觉好心痛哈,宣传一下,首先这套数据的文章发表在Frontiers in Genetics,文章标题 Integrative analysis of Iso-Seq and RNA-seq reveals dynamic changes of alternative promoter, alter…
作者使用10x Genomics Chromium平台构建单细胞RNA-seq文库,并在Illumina HiSeq PE150平台进行测序(图1a)。实验包括四个睾丸治疗组,覆盖成年大鼠的一个完整的间质细胞耗竭和替代周期。通过血清睾酮测定验证了乙烷二甲烷磺酸盐(EDS)诱导的Leydig细胞消除(E1W)和再生(E3W和E7W)的过程(图1b)。对于测序过程,饱和曲线分析...
7. LncRNA-seq中的数据是否同时有lncRNA和mRNA? 根据rRNA去除的建库方案,测序结果中既包含lncRNA,也包括mRNA,所以客户在做lncRNA项目的同时,也可以利用同一套测序数据进行mRNA的分析。 8. lncRNA-seq分析内容有哪些? 分析报告包括:测序数据质量分析、参考基因组比对分析、转录组组装与新转录本预测、新长链非编码RN...
LINC00958在食管鳞癌中的作用研究 食管癌是世界上最具致命性和侵略性的肿瘤之一,具有两种最常见的组织学亚型:鳞状细胞癌和腺癌.食管鳞癌多分布在亚洲和撒哈拉以南非洲的部分低收入地区,主要与吸烟和饮... 王碧琪 - 《北京工业大学》 被引量: 0发表: 2021年...
因此,研究人员首先使用miRNA-seq技术研究了正常对照和CUMS诱导的抑郁大鼠海马DG中的miRNA表达谱。结果发现57个miRNAs在抑郁和正常DG样品之间存在显著差异,其中有9个上调,48个下调。这些结果表明,正常和抑郁大鼠DG组织中miRNAs的差异表达存在明显差异。qPCR检测发现与正常大鼠相比,miR-26a-3p、miR-1298、miR-211-5p和miR...
RNA-seq更适合对低丰度RNA分子的检测。 • LncRNA更新最及时,覆盖最全面:对最新的公共转录组数据库中的LncRNAs进行广 泛的收集,包括RefSeq [1], Ensembl [2], lncRNAdb [3]数据库和权威期刊[4-8]. • 可靠的LncRNA收集:利用严格的计算方法,从数据库和经典文献中筛选更加可靠的 LncRNAs分子。 • 转录...
研究内容1.应用低压低氧实验舱模拟高原环境,构建高原低氧心肌损伤大鼠模型。应用组织病理学和超声心动图等检查评价模型。2.通过RNA-Seq技术检测高原低氧环境下大鼠心肌组织mi RNA和m RNA表达谱,筛选差异表达mi RNA和m RNA。应用生物信息学方法分析差异表达mi RNA和m RNA的GO功能富集和KEGG通路分析。3.分析心肌组织中...
「杂志俱乐部」单细胞rna序列揭示糖尿病大鼠机械性痛觉异常的应用(浙大一院疼痛科|陈磊) 浙大一院疼痛科 2023-01-13 11:24 发表于 浙江 ,时长 08:57 本期文献 the development of mechanical allodynia in diabetic rats revealed by s...
同时对大鼠脑缺血区的脑血管做了二代的RNA-seq高通量测序。我们试图在大鼠脑急性缺血模型和慢性缺血模型中寻找在血管生成和侧支循环形成的异同,为可能的基因调控靶点提供一些证据。第一部分大鼠急性、慢性缺血模型及侧支循环的建立试验方法:建立大鼠MCAO模型和慢性缺血模型,选成年雄性Wistar健康大鼠,随机分成三组:A组(...