The MR-PRESSO global test evaluates overall horizontal pleiotropy among all IVs in a single MR test by comparing the observed distance of all the variants to the regression line (residual sum of squares) with th
2. 利用“MR-PRESSO distortion test”来检验矫正前和矫正后的结果是否存在差异
所以,用孟德尔随机化进行因果关系推断的大前提是没有水平多效性。 讲完理论知识,下面具体讲讲如何用MR-PRESSO检验水平多效性。 2、使用MR-PRESSO检验水平多效性 下载、安装: if (!require("devtools")) { install.packages("devtools") } else {} devtools::install_github("rondolab/MR-PRESSO",force = TR...
MR-PRESSO是用于检验水平基因多效性的方法,发表于2018年的Nature Genetics,目前被引用343次。检验水平多效性的目的是确保孟德尔随机化分析的工具变量(如遗传位点)仅通过暴露因素影响结果,而非直接作用于结果。如果工具变量违反孟德尔随机化原则,那么我们称存在水平多效性。例如,一个SNP位点同时与大胸和...
孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,就是假定SNP位点rs123同时与大...
在遗传学研究中,MR-PRESSO是一个重要的工具,用于检测在孟德尔随机化分析中假设的水平基因多效性,这个概念在2018年的Nature Genetics论文中首次提出并广泛引用,截至现在已有343次引用。孟德尔随机化分析的核心在于,它假定遗传位点(工具变量)通过暴露因素影响结果变量,若这个假设被打破,就存在水平多效性...
所以,用孟德尔随机化进行因果关系推断的大前提是没有水平多效性。 讲完理论知识,下面具体讲讲如何用MR-PRESSO检验水平多效性。 2、使用MR-PRESSO检验水平多效性 下载、安装: if (!require("devtools")) { install.packages("devtools") } else {}devtools::install_github("rondolab/MR-PRESSO",force = TRUE...
使用MR-PRESSO检验水平基因多效性(孟德尔随机化分析) 2020-07-11 14:48 −... 橙子牛奶糖 2 12242 POJ2279 Mr Young's Picture Permutations[动态规划] 2019-04-14 11:55 −Mr.Young′s Picture PermutationsMr.Young's Picture PermutationsMr.Young′s... ...
5.6(https://http://mrcieu.github.io/TwoSampleMR/)进行孟德尔随机化分析,使用R软件包RACER版本...
在多变量孟德尔随机化(MVMR)分析中,您可以使用pleiotropy_mvmr和mr_presso这两个函数来检验多效性,但它们的目的和方法有所不同。以下是这两个函数的比较和使用建议: 1. pleiotropy_mvmr 目的:pleiotropy_mvmr函数用于评估多效性对多变量孟德尔随机化结果的影响。它可以帮助您理解遗传变异对多个暴露因素的影响是否存...