The MR-PRESSO global test evaluates overall horizontal pleiotropy among all IVs in a single MR test by comparing the observed distance of all the variants to the regression line (residual sum of squares) with the expected distance under the null hypothesis of no horizontal pleiotropy[1]. MR-PRE...
在多变量孟德尔随机化(MVMR)分析中,您可以使用pleiotropy_mvmr和mr_presso这两个函数来检验多效性,但它们的目的和方法有所不同。以下是这两个函数的比较和使用建议: 1. pleiotropy_mvmr 目的:pleiotropy_mvmr函数用于评估多效性对多变量孟德尔随机化结果的影响。它可以帮助您理解遗传变异对多个暴露因素的影响是否...
1、为什么要检验水平多效性 孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,...
孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,就是假定SNP位点rs123同时与大...
04.去除弱工具变量,筛选F值大于10的SNP【本地41炎症因子孟德尔随机化分析】 281 -- 3:54 App 07.结局芬兰数据下载和转化【微量元素批量本地孟德尔随机化分析】 997 -- 5:18 App 13.共定位分析(locuscompare包)【药物靶点孟德尔随机化(共定位/eQTL)】 568 -- 8:45 App 01.课程简介,高分SCI热点套路【91炎...
MR-PRESSO是用于检验水平基因多效性的方法，发表于2018年的Nature Genetics，目前被引用343次。检验水平多效性的目的是确保孟德尔随机化分析的工具变量（如遗传位点）仅通过暴露因素影响结果，而非直接作用于结果。如果工具变量违反孟德尔随机化原则，那么我们称存在水平多效性。例如，一个SNP位点同时与大胸和...
【MR培训1】 孟德尔随机化简介与GWAS数据获取 R语言基础、从SCI获取数据、剔除混杂因素SNP、F统计量的计算 1:06:53 【MR培训2】 两样本孟德尔随机化实操与文献解读 敏感性分析、异质性检验、多效性检验、外部验证 1:29:55 【MR培训3】 中介孟德尔随机化理论与实操 中介效应值的计算、自动寻找中介暴露结局 37:...
在遗传学研究中，MR-PRESSO是一个重要的工具，用于检测在孟德尔随机化分析中假设的水平基因多效性，这个概念在2018年的Nature Genetics论文中首次提出并广泛引用，截至现在已有343次引用。孟德尔随机化分析的核心在于，它假定遗传位点（工具变量）通过暴露因素影响结果变量，若这个假设被打破，就存在水平多效性...
所以,用孟德尔随机化进行因果关系推断的大前提是没有水平多效性。 讲完理论知识,下面具体讲讲如何用MR-PRESSO检验水平多效性。 2、使用MR-PRESSO检验水平多效性 下载、安装: if (!require("devtools")) { install.packages("devtools") } else {}devtools::install_github("rondolab/MR-PRESSO",force = TRUE...
使用MR-PRESSO检验水平基因多效性(孟德尔随机化分析) 2020-07-11 14:48 −... 橙子牛奶糖 2 11929 POJ2279 Mr Young's Picture Permutations[动态规划] 2019-04-14 11:55 −Mr.Young′s Picture PermutationsMr.Young's Picture PermutationsMr.Young′s... ...