The MR-PRESSO global test evaluates overall horizontal pleiotropy among all IVs in a single MR test by comparing the observed distance of all the variants to the regression line (residual sum of squares) with the expected distance under the null hypothesis of no horizontal pleiotropy[1]. MR-PRE...
08.孟德尔随机化分析,森林图、漏斗图、散点图、多效性、异质性检验【0基础半小时学会孟德尔随机化R语言快速发SCI课程】【0基础半小时学会孟德尔随机化R语言快速发SCI课程】可做内容覆盖范围广(医学、心理学、经济学等领域),是新的研究方法,很少人会,期刊、单位都接受
许多代谢物水平有很高的遗传力，这为孟德尔随机化(MR)提供了机会。
1、为什么要检验水平多效性 孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,...
孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,就是假定SNP位点rs123同时与大...
MR-PRESSO是用于检验水平基因多效性的方法，发表于2018年的Nature Genetics，目前被引用343次。检验水平多效性的目的是确保孟德尔随机化分析的工具变量（如遗传位点）仅通过暴露因素影响结果，而非直接作用于结果。如果工具变量违反孟德尔随机化原则，那么我们称存在水平多效性。例如，一个SNP位点同时与大胸和...
在遗传学研究中，MR-PRESSO是一个重要的工具，用于检测在孟德尔随机化分析中假设的水平基因多效性，这个概念在2018年的Nature Genetics论文中首次提出并广泛引用，截至现在已有343次引用。孟德尔随机化分析的核心在于，它假定遗传位点（工具变量）通过暴露因素影响结果变量，若这个假设被打破，就存在水平多效性...
请问孟德尔随机化分析,如果检验存在多效性应该怎么办? 5 个回答 孟德尔随机化检验是否为弱工具变量时的R2和F统计量还有I2怎么计算? 3 个回答 两样本孟德尔随机化研究中何时需要进行多重检验? 4 个回答 孟德尔随机化研究结局用β和用OR有何区别,两者如何换算? 9 个回答 ...
孟德尔随机化分析有三个假设,其中的一个假设就是工具变量(一般是遗传位点)必须通过暴露因素(exposure,大胸)影响结果(outcome,不爱运动)。 如果工具变量可以不通过暴露因素直接影响结果,那么就违反了孟德尔随机化的思想,即检验结果存在水平多效性。 上面一段话是不是很拗口,用直白的话说,就是假定SNP位点rs123同时与大...
所以,用孟德尔随机化进行因果关系推断的大前提是没有水平多效性。 讲完理论知识,下面具体讲讲如何用MR-PRESSO检验水平多效性。 2、使用MR-PRESSO检验水平多效性 下载、安装: if (!require("devtools")) { install.packages("devtools") } else {}devtools::install_github("rondolab/MR-PRESSO",force = TRUE...