基因药物预测数据库是一个利用生物信息学方法,通过分析基因与药物的关系,预测药物对基因的影响,从而为药物研发和临床治疗提供决策支持的数据库。基于基因表达谱、基因突变信息、药物作用机制等多种数据进行综合分析,预测药物对特定基因的影响。例如,通过预测药物对肿瘤相关基因的影响,可以为抗肿瘤药物的研发提供参考,提高药...
点击Compound目录下FDA,整体展示FDA批准药物及靶基相关信息。 点击Important Compound,按FDA批准、实验验证、预测和其他证据类型分别展示药物与靶基因信息。 点击Chemical Structure以化合物结构式进行检索。以丙酸为例,在画板处绘制结构式或检索框输入SMILES表达式,右侧设置检索条件(检索类型如子结构、相似性或精确检索,药理...
本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库,miRBase,miRTarBase,miRcode,starbase,Targetscan。实战部分,介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据,批量预测miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系。 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及...
Drug names: 列出了候选药物的名称及其在数据库中的ID。 P-value: 显示了药物与基因之间关联的原始P值。 Adjusted P-value: 显示了经过校正后的P值,这些值通常用于减少多重检验带来的假阳性。 Genes: 列出了与每种药物相关的基因。 展开更多万物研究所 知识 科学科普 DSigDB 基因预测药物 药物 万物研究所·...
摘要 目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素。方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁...展开更多 作者 桂照华 张敏 刘大伟 李晓洁 何杰 机构地区 中国科学技术大学第一附属医院临床...
目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素.方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁)的临床信息及BRCA基因测序数据,根据是否发生BRCA基因突变分为突变组(176例)和野生组(344例),分析BRCA基因突...
记录活性成分PubChem ID、靶点名称,通过Sting平台转换靶点蛋白名称为基因名称,通过PubChem数据库搜索文献报道的靶点,合并所有的药物靶点用于后续研究。 2.2腹泻疾病靶点预测 通过人类基因数据库(GeneCards)和DisGeNET数据库检索腹泻疾病基因。在Genecards数据库中选择关联分数>20的基因[8],在DisGeNET数据库中选择证据指数(...
上述数据来源于文献报道、美国专利信息、PubChem BioAssays和ChEMBL数据库等。其中药物与靶基因亲和力数据基于酶抑制活性和酶动力学、等温滴定量热法(ITC)、核磁共振(NMR)和放射性配体竞争测定法等实验技术。该数据库功能强大,可根据药物化合物预测...
三分钟学会药物敏感性预测分析 科研君Anky 14:05 F06.药物靶点获取genecard、omim、pahrmgkb、TTD、drugbank等网站获取疾病靶点【零基础,半天学会中药复方网络药理学与分子对接】 创业A计划 12:13 网络药理学-Part2--中药成分靶点预测(SWISS、Pharmmapper) ...