基因药物预测数据库是一个利用生物信息学方法,通过分析基因与药物的关系,预测药物对基因的影响,从而为药物研发和临床治疗提供决策支持的数据库。基于基因表达谱、基因突变信息、药物作用机制等多种数据进行综合分析,预测药物对特定基因的影响。例如,通过预测药物对肿瘤相关基因的影响,可以为抗肿瘤药物的研发提供参考,提高药...
然后,构建药物-靶基因相互作用(DTI)网络,数据来源包括直接DTI数据库(ChEMBL和BindingDB数据库)、间接DTI数据库(STITCH 5、Herbal Components' Targets Database和TCMID数据库)以及2000多高质量天然产物药理学研究文献,最终获得包含3848种天然产物与...
本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库,miRBase,miRTarBase,miRcode,starbase,Targetscan。实战部分,介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据,批量预测miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系。 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及...
29. 手把手教学oncoPredict包预测药物敏感性 生信幻想家 62750 23:10 网络药理学第四篇——中药成分靶点预测(TCMSP、Swisstargetprediction、PharmMapper、GEO等数据库) 我是小阿标啊 08:23 三分钟学会药物敏感性预测分析 科研君Anky 14:05 F06.药物靶点获取genecard、omim、pahrmgkb、TTD、drugbank等网站获取疾病靶...
目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素.方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁)的临床信息及BRCA基因测序数据,根据是否发生BRCA基因突变分为突变组(176例)和野生组(344例),分析BRCA基因突...
摘要 目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素。方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁...展开更多 作者 桂照华 张敏 刘大伟 李晓洁 何杰 机构地区 中国科学技术大学第一附属医院临床...
通过TCMSP、PubChem等数据库检索到63个活性成分的664个药物靶点;同时通过GeneCards和DisGeNET数据库检索到腹泻相关疾病基因1025个。将药物靶点与疾病基因进行交集,得到277个小儿广朴止泻口服液治疗腹泻的潜在作用靶点。 3.2小儿广朴止泻口服液化合物-靶点网络的构建及拓扑分析...
通过TCMSP、PubChem等数据库检索到63个活性成分的664个药物靶点;同时通过GeneCards和DisGeNET数据库检索到腹泻相关疾病基因1025个。将药物靶点与疾病基因进行交集,得到277个小儿广朴止泻口服液治疗腹泻的潜在作用靶点。 3.2小儿广朴止泻口服液化合物-靶点网络的构建及拓扑分析...