DGIdb数据库(Drug-Gene Interaction database),是一个药物-基因相互作用数据库,提供了基因与其已知或潜在药物关联信息,目前已经更新到4.0版本。里面的基因主要是癌基因,但是也有一些其他疾病(例如阿尔兹海默病、心脏病、糖尿病等)的相关基因。DGIdb一共有超过14000种药物-基因的相互作用,涉及2600个基因和6300中靶向这些...
DGIdb数据库(Drug–Gene Interaction Database)整合现有的文献报道中药物与基因互作关系,以及DrugBank、PharmGKB、Chembl、Drug Target Commons和TTD等30多个数据库中药物与基因互作关系,提供两类数据:第一类,基于文献报道的已知药物与基因相互作用关系;第二类,根据药物或基因家族之间功能、结构等特征预测的潜在药物与基因相...
数据库的功能数据聚合: 整合来自不同来源的基因、药物及其相互作用的数据,提供一个统一的资源库。 数据可视化: 通过动态可视化工具,使用户能够直观地探索和分析药物和基因之间的相互作 用。 搜索和查询: 提供基于Web的用户界面和API,允许用户通过药物、基因或相互作用类型进行 搜索和查询。 GraphQL API: 支持GraphQL...
药物基因组学数据库 Drugbank 2、dgidb pharmGKB 4、cancercommon ://cancercommon/ 5、ChEMBL 6、mycancergenome 7、TTD 8、guidetopharmcology 9、clearityfoundation CIViC s://civic.genome.wustl.edu/#/home DoCM 1Drugbank 药物和药物靶标资源库。。广泛应用于计算机辅助的药物靶标的发现、药物设计、药物分...
基因药物预测数据库是一个利用生物信息学方法,通过分析基因与药物的关系,预测药物对基因的影响,从而为药物研发和临床治疗提供决策支持的数据库。基于基因表达谱、基因突变信息、药物作用机制等多种数据进行综合分析,预测药物对特定基因的影响。例如,通过预测药物对肿瘤相关基因的影响,可以为抗肿瘤药物的研发提供参考,提高药...
DGIdb数据库(Drug-Gene Interaction database),是一个药物-基因相互作用数据库,提供了基因与其已知或潜在药物关联信息,目前已经更新到4.0版本。里面的基因主要是癌基因,但是也有一些其他疾病(例如阿尔兹海默病、心脏病、糖尿病等)的相关基因。DGIdb一共有超过14000种药物-基因的相互作用,涉及2600个基因和6300个靶向这些...
Interaction Types:DGIdb将药物-基因间的作用分为33种,有促进表达,有抑制表达,有cofactor,等等。用户可以根据自己需求筛选与基因positive or negative作用的药物。 参数设置好后,数据库搜索返回结果页面: 这里给出了gene,drug, interaction type and source database用户也可以将结果下载为TSV文件。
Connectivity Map (CMap:https://portals.broadinstitute.org/cmap/) 包含了大约1300多个现存药物或尚在实验室研究的小分子处理细胞后的microarray基因表达数据。该数据库于2006被公开发表于Science和Nature从而面向大众使用,是迄今为止最全面的关于药物干扰处理的开放的转录组数据库,隶属于美国麻省理工学院、哈佛大学共同创...
肿瘤药物敏感性基因组学数据库(Genomics of Drug Sensitibity in Cancer,GDSC)由英国桑格研究院开发,收集肿瘤细胞对药物的敏感度和反应数据。癌基因组的变异会影响临床治疗的效果,不同的靶点对药物的反应也有很大不同。因此这类数据对于发现潜在的肿瘤治疗靶点十分重要。
Connectivity Map(CMap)数据库的重要性与地位，及其在药物基因组学研究领域中的作用，不容忽视。该数据库自2006年推出，至今已更新至第二版，累计引用超过3000次。CMap旨在通过基因表达量的变化揭示药物、基因与疾病之间的功能联系。在药物组合与药物重定位研究中，CMap展现出越来越关键的角色。数据库包含...