点击Compound目录下FDA,整体展示FDA批准药物及靶基相关信息。 点击Important Compound,按FDA批准、实验验证、预测和其他证据类型分别展示药物与靶基因信息。 点击Chemical Structure以化合物结构式进行检索。以丙酸为例,在画板处绘制结构式或检索框输入SMILES表达式,右侧设置检索条件(检索类型如子结构、相似性或精确检索,药理...
然后,构建药物-靶基因相互作用(DTI)网络,数据来源包括直接DTI数据库(ChEMBL和BindingDB数据库)、间接DTI数据库(STITCH 5、Herbal Components' Targets Database和TCMID数据库)以及2000多高质量天然产物药理学研究文献,最终获得包含3848种天然产物与...
本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库,miRBase,miRTarBase,miRcode,starbase,Targetscan。实战部分,介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据,批量预测miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系。 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及...
单体药物如何预测作用靶点、靶基因呢？