惊喜!10+SCI用这个数据库添彩,靶基因-药物预测,就靠它了! 嗨,小伙伴们大家好!新的一周我们继续聚焦药物与靶基因查询话题。不少小伙伴问“根据药物查询靶基因,让我们更方便探寻药物下游机制问题! 如果在功能基因单变量论证之后在上游找药物,该… 酸菜发表于解螺旋 11分+SCI 基因集泛癌纯生信分析,两个多月接受,...
然后,构建药物-靶基因相互作用(DTI)网络,数据来源包括直接DTI数据库(ChEMBL和BindingDB数据库)、间接DTI数据库(STITCH 5、Herbal Components' Targets Database和TCMID数据库)以及2000多高质量天然产物药理学研究文献,最终获得包含3848种天然产物与...
本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库,miRBase,miRTarBase,miRcode,starbase,Targetscan。实战部分,介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据,批量预测miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系。 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及...
本地基于序列预测miRNA靶基因,理论结合实践,介绍常用的三种本地基于序列预测miRNA靶基因的工具。可用于预测miRNA-mRNA, miRNA-lncRNA, miRNA-circRNA之间的调控关系。任何物种理论上都可以使用这三个本地工具进行预测,只要能获取相应的序列。 lesson1 miRNA种子序列概念 lesson2 targetscan family info, target file文件...
单体药物如何预测作用靶点、靶基因呢？