上述数据来源于文献报道、美国专利信息、PubChem BioAssays和ChEMBL数据库等。其中药物与靶基因亲和力数据基于酶抑制活性和酶动力学、等温滴定量热法(ITC)、核磁共振(NMR)和放射性配体竞争测定法等实验技术。该数据库功能强大,可根据药物化合物预测潜在靶基因,或根据靶基因预测潜在药物化合物,还有许多小工具。 左侧栏...
本课程理论结合实战讲解miRNA靶基因预测。介绍了miRNA相关的常用数据库,miRBase,miRTarBase,miRcode,starbase,Targetscan。实战部分,介绍了如何使用R代码基于starbase和targetscan数据库中的数据,批量预测miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系。 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及...
摘要 目的利用TCGA数据库探讨乳腺癌易感基因(BRCA)突变与卵巢高级别浆液性癌(HGSOC)临床病理特征的相关性及对患者铂类药物化疗后预后的独立预测因素。方法纳入TCGA数据库中520例卵巢高级别浆液性癌患者(年龄≥60岁...展开更多 作者 桂照华 张敏 刘大伟 李晓洁 何杰 机构地区 中国科学技术大学第一附属医院临床...
另外作者还分析了不同疾病亚组中关键基因的表达。还可以借鉴作者分析转录因子的方法,即从数据库下载转录因子(TFs)基因集合,与DEGs取交集得到差异表达TFs,再构建调控网络。 当然,还可以对此分析思路进行升级,比如增加CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润,分析靶向关键基因的潜在药物,也可以加入湿实验来验证结果,也是很好的加分项...
上述数据来源于文献报道、美国专利信息、PubChem BioAssays和ChEMBL数据库等。其中药物与靶基因亲和力数据基于酶抑制活性和酶动力学、等温滴定量热法(ITC)、核磁共振(NMR)和放射性配体竞争测定法等实验技术。该数据库功能强大,可根据药物化合物预测...