这篇推文主要探讨下WGCNA如何处理分类性状。 eigengenes可以代表某个模块,在计算出模块的eigengenes后,下一步就是探索eigengenes和性状之间的关系,也就是模块和性状之间的关系。 大家见到的比较多的是计算相关性,此时需要性状是数字才行。但是大家的性状有很多分类变量,此时应该如何处理呢? 以下是常规的分类变量处理原则...
个等级。最极端的是一个阈值的性状,称为“全或无”性状,如存活 与死亡,发病与不发病等。 分类性状(categoricaltrait) 可归为质量性状。例如根据人类的ABO血型系统,可以把所有人 群的每个个体分为A型、B型、O型和AB型。由单基因决定的孟德尔遗 传的性状,显性与隐性也可看成是分类性状。
binarizeCategoricalVariable()是针对1个变量的,通常我们的性状数据都是包含在1个数据框中的,并且可能同时有多个分类变量,此时可以使用binarizeCategoricalColumns()。 比如,对于我们之前用过的datTraits这个性状数据,我们假设其中的stage和msi是无序多分类变量,然后对这两个变量进行转换: 代码语言:javascript 复制 load(fil...
这篇推文主要探讨下WGCNA如何处理分类性状。之前已经演示过WGCNA实战了:WGCNA实战:识别免疫相关lncRNA eigengenes可以代表某个模块,在计算出模块的eigengenes后,下一步就是探索eigengenes和性状之间的关系,也就是模块和性状之间的关系。 大家见到的比较多的是计算相关性,此时需要性状是数字才行。但是大家的性状有很多分类...
药品的分类 药品按照性质分类包括中药材、中药饮片、中成药、中西成药,化学原料药及其制剂、抗生素、生化药品、放射性药品、血清、疫苗、血液制品和诊断药品等。 药品性状分类 片剂 肠溶片、包衣片、薄膜衣片、糖衣片、浸膏片、分散片、划痕片、缓释片、缓释包衣片、控释片 ...
最有用的分类性状是共有衍征,共有衍征是起源于一个共有祖先并且为其所有的后裔所共有的性状。简单粗暴的解释一下就是一个祖宗的所有后代均具有的性状,该性状是源于他们老祖宗的性状,那么依靠这样性状就可以把老祖宗和其子代归为一个大家族。这样的性状就是他们这个大家族血缘关系的证明或者说是纽带。非同源相似...
青田石的主要性状 青田石学名叶腊石、主要矿物成份为叶腊石和石英,共生矿物有刚玉、火铝石、红柱石、高岭石和少量蓝线石、绿石等。 主要化学成份是氧化铝和氧化硅,有腊质感,均质块状,摩氏硬度二级,密度为2.6~2.7砘/立方米。耐火度:1630c°—1730c°,白度70至90c°...
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药品性状分类与简介|药品性状根据《中华人民共和国药品管理法》第一百零二条关于药品的定义:药品是指用于预防、治疗、诊断人的疾病,有目的地调节人的生理机能并规..