新格元单细胞转录组二代+三代解决方案,利用GEXSCOPE®平台对单细胞mRNA捕获后进行反转录生成cDNA,利用同一份cDNA分成两部分,分别构建二代测序文库和三代测序文库,流程优化简单,二、三代单细胞优势互补,大幅降低整体实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。并且在数据分析上相较于单独的单细胞二代或...
同一份cDNA被分为两部分,分别构建二代和三代测序文库,实现了流程的优化和简化。这种二、三代测序的互补策略大幅降低了实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。在数据分析方面,二代+三代测序的结合使得细胞聚类和细胞注释更加精确。同时,三代测序的超长读长为我们提供了mRNA的全长序列和结构信息。 ...
结果表明（表1），使用Kinnex全长转录组测序预测出的基因个数多于短读长测序技术预测的基因数，平均转录...
AlaATs编码的DEGs转录水平在淹水胁迫下大部分上调。RNA-Seq和qRT-PCR结果均显示,在淹水胁迫下,i2_HQ_K_c171325/f20p0/2198和i2_HQ_K_c146831/f7p5/2147的转录水平显著提高。 图9 淹水胁迫下KR5根系AlaAT转录水平和酶活性的变化 淹水胁迫下的谷氨酸含量显著高于对照组。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸依赖性谷氨酸合成酶...
三代全长转录组测序,又称为iso-seq,是基于Pacbio三代测序平台进行的mRNA测序研究。这种技术以其超长读长的特点著称,无需打断和拼接,便能捕获到完整的5’和3’UTR,以及ploy A tail。这一方法克服了传统二代测序的短板,如较短的读长、转录本拼接的不完整性,从而能够揭示单个mRNA分子从5’到3’端的高质量转录...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术能够揭示单个细胞的分子状态,解析组织异质性,是研究复杂生物体的利器。但是基于短读长的NGS二代测序策略,难以获得单个细胞中全长转录本的准确信息。 三代测序相较于二代测序,能够测到转录本的全长,...
1.一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法,其特征在于,包括下述步骤: 步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息; 步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息; 步骤3:结合各编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信息,获...
二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜，读长短（一般是PE150），但是reads数量巨大，6G...
现在很多分子实验都需要测序了吧，目前拿到了公司给的数据，然后自己分析，有共同道路的同志们吗，一起...
本发明涉及基因组注释技术领域,提供一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法。本发明的方法包括下述步骤:步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息;步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息;步骤3:结合各编码基因的初始结构...