中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料,结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析,揭示了猕猴桃的耐涝机制,并在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208/化学2区)期刊上发表了题为“Full-Length Transcriptome and RNA-Seq Analyses Reveal the Mechanisms Underlying...
中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料,结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析,揭示了猕猴桃的耐涝机制,并在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208/化学2区)期刊上发表了题为“Full-Length Transcriptome and RNA-Seq Analyses Reveal the Mechanisms Underlying...
二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜，读长短（一般是PE150），但是reads数量巨大，6G...
1.一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法,其特征在于,包括下述步骤: 步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息; 步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息; 步骤3:结合各编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信息,获...
步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息; 步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息; 步骤3:结合各编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信息,获得各编码基因的最终结构信息。
本发明涉及基因组注释技术领域,提供一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法。本发明的方法包括下述步骤:步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息;步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息;步骤3:结合各编码基因的初始结构...
摘要 黑穗病是甘蔗生产中的主要病害,严重影响甘蔗产量。解析甘蔗重要亲本与黑穗病菌相互作用的分子机制及筛选抗病基因对抗黑穗病优良品种的培育具有重要意义。本研究选用我国甘蔗育种中的重要亲本新台糖ROC25(抗黑穗病)及其姊妹系RO...展开更多 Sugarcane smut,caused by the fungus Sporisorium scitamineum,is the ...
奥维森提供了三代全长和二代转录组测序及分析服务。 01 研究背景 在淹水的土壤中,根组织被淹没在水中,导致根际周围的氧气浓度迅速下降。缺氧限制了根部的有氧呼吸,导致能量不足,对植物生长发育造成伤害。猕猴桃具有耐涝性,然而,这一特征背后的机制尚不清楚。
本发明的方法包括下述步骤:步骤 1:将 三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得 到各编码基因的初始结构信息;步骤 2:将二代 转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文 件中提取内含子剪切位点信息;步骤 3:结合各 编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信 息,获得各编码基因的最终结构信息。本发明既 能...
奥维森提供了三代全长和二代转录组测序及分析服务。 01 研究背景 在淹水的土壤中,根组织被淹没在水中,导致根际周围的氧气浓度迅速下降。缺氧限制了根部的有氧呼吸,导致能量不足,对植物生长发育造成伤害。猕猴桃具有耐涝性,然而,这一特征背后的机制尚不清楚。