新格元单细胞转录组二代+三代解决方案,利用GEXSCOPE®平台对单细胞mRNA捕获后进行反转录生成cDNA,利用同一份cDNA分成两部分,分别构建二代测序文库和三代测序文库,流程优化简单,二、三代单细胞优势互补,大幅降低整体实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。并且在数据分析上相较于单独的单细胞二代或...
结果表明（表1），使用Kinnex全长转录组测序预测出的基因个数多于短读长测序技术预测的基因数，平均转录...
通过结合二代和三代测序,我们能够在控制成本的同时,获得转录本的全长序列,并利用Cell Barcode信息精确定位到细胞亚群。 产品概述与亮点 基于二代测序的坚实基础,新格元进一步推出了创新的单细胞转录组二代+三代测序方案。该方案不仅涵盖了二代测序的优势,还新增了全长检测的三代测序,从而提供了更全面的分析内容,包括...
三代全长转录组测序,又称为iso-seq,是基于Pacbio三代测序平台进行的mRNA测序研究。这种技术以其超长读长的特点著称,无需打断和拼接,便能捕获到完整的5’和3’UTR,以及ploy A tail。这一方法克服了传统二代测序的短板,如较短的读长、转录本拼接的不完整性,从而能够揭示单个mRNA分子从5’到3’端的高质量转录...
奥维森提供了三代全长和二代转录组测序及分析服务。 01 研究背景 在淹水的土壤中,根组织被淹没在水中,导致根际周围的氧气浓度迅速下降。缺氧限制了根部的有氧呼吸,导致能量不足,对植物生长发育造成伤害。猕猴桃具有耐涝性,然而,这一特征背后的机制尚不清楚。
单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术能够揭示单个细胞的分子状态,解析组织异质性,是研究复杂生物体的利器。但是基于短读长的NGS二代测序策略,难以获得单个细胞中全长转录本的准确信息。 三代测序相较于二代测序,能够测到转录本的全长,...
1.一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法,其特征在于,包括下述步骤: 步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息; 步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息; 步骤3:结合各编码基因的初始结构信息和内含子剪切位点信息,获...
二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜，读长短（一般是PE150），但是reads数量巨大，6G...
本发明涉及基因组注释技术领域,提供一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法。本发明的方法包括下述步骤:步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息;步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息;步骤3:结合各编码基因的初始结构...
摘要 黑穗病是甘蔗生产中的主要病害,严重影响甘蔗产量。解析甘蔗重要亲本与黑穗病菌相互作用的分子机制及筛选抗病基因对抗黑穗病优良品种的培育具有重要意义。本研究选用我国甘蔗育种中的重要亲本新台糖ROC25(抗黑穗病)及其姊妹系RO...展开更多 Sugarcane smut,caused by the fungus Sporisorium scitamineum,is the ...