总的来说,这些数据表明YBX1可以以调节NSUN2和m5C依赖的方式结合并稳定SMOX mRNA。 图4:ESCC中mRNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)特征。 (A)ELISA测定ESCC组织与邻近正常食管组织纯化mRNA中m5C的表达水平。 (B)western blot检测NSUN2的沉默和过表达效率。 (C)ELISA检测NSUN2敲低或过表达ESCC细胞中mRNA上m5C的表达水平。
结合m5C MeRIP-seq和RNA-seq发现223个mRNA在NSUN2敲低后mRNA表达和m5C甲基化水平均显著下调,其中3个直接与YBX1结合(图5A)。有趣的是,我们注意到精胺氧化酶(SMOX)在ESCC组织中过表达(图5B)。IGV分析显示,NSUN2敲低后,KYSE150细胞中SMOX的m5C水平显著降低,并且SMOX的CDS中含有m5C位点,与YBX1的结合位点吻合(...
验证了NSUN2通过其m5C甲基化酶活性部分依赖性地促进乳腺癌进展。 通过收集患者的乳腺癌组织,并结合RNA-Seq和RNA-BS数据,筛选了m5C修饰位点,并在单碱基分辨率水平上鉴定出关键靶标HGH1。 (2)NSUN2/YBX1依赖于m5C调控HGH1 mRNA稳定性和表达的分子机制: 通过体内外实验阐明了NSUN2/YBX1依赖于m5C来调控HGH1 mRNA...
验证了NSUN2通过其m5C甲基化酶活性部分依赖性地促进乳腺癌进展。 通过收集患者的乳腺癌组织,并结合RNA-Seq和RNA-BS数据,筛选了m5C修饰位点,并在单碱基分辨率水平上鉴定出关键靶标HGH1。 (2)NSUN2/YBX1依赖于m5C调控HGH1 mRNA稳定性和表达的分子机制: 通过体内外实验阐明了NSUN2/YBX1依赖于m5C来调控HGH1 mRNA...
(3)RNA-Seq联合RNA-Bisseq筛选确定HGH1为乳腺癌m5C调控的潜在靶基因 由于NSUN2是负责RNA m5C修饰的主要甲基转移酶,研究人员分析了NSUN2促进乳腺癌(BC)进展机制:从5名临床患者中选择癌症和邻近组织样本,进行转录组分析(RNA-seq)和mRNA m5C亚硫酸盐测序(RNA-BS)。
RNA m5C甲基化已被证明广泛参与肿瘤的发生和发展。作为主要的m5C甲基转移酶,NSUN2在多种肿瘤类型中发挥着关键的调控作用。但NSUN2介导的m5C修饰对乳腺癌(BC)的具体作用仍不清楚。 郑州大学第一附属医院/河南省精准临床药学重点实验室阚全程、田鑫团队和中国科学院大学杨运桂合作阐明NSUN2如何通过m5C修饰调控靶基因HGH...
(3)RNA-Seq联合RNA-Bisseq筛选确定HGH1为乳腺癌m5C调控的潜在靶基因 由于NSUN2是负责RNA m5C修饰的主要甲基转移酶,研究人员分析了NSUN2促进乳腺癌(BC)进展机制:从5名临床患者中选择癌症和邻近组织样本,进行转录组分析(RNA-seq)和mRNA m5C亚硫酸盐测序(RNA-BS)。
YBX1以m5c依赖的方式促进H型血管依赖的骨形成 期刊名称:JCI insight 期刊IF:8.0 项目材料:人脐静脉内皮细胞HUVEC 爱基百客提供技术服务:CLIP-Seq 合作单位:内分泌学研究中心 Title(E):YBX1 promotes type H vessel–dependent bone formation in an m5C-dependent manner...
研究对象:5-Methylcytosine (m5C), NSUN2, E2F1, YBX1, and ovarian cancer;期刊:Experimental & Molecular Medicine;影响因子:12.7998;合作单位:重庆医科大学第三附属医院;发表时间:2024年4月 摘要 5-Methylcytosine (m5C) is a common RNA modification that modulates gene expression at the posttranscriptional ...
RNA 5-methylcytosine (m5C) modification plays critical roles in the pathogenesis of various tumors. However, the function and molecular mechanism of RNA m5C modification in tumor drug resistance remain unclear. The correlation between RNA m5C methylation