总的来说,这些数据表明YBX1可以以调节NSUN2和m5C依赖的方式结合并稳定SMOX mRNA。 图4:ESCC中mRNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)特征。 (A)ELISA测定ESCC组织与邻近正常食管组织纯化mRNA中m5C的表达水平。 (B)western blot检测NSUN2的沉默和过表达效率。 (C)ELISA检测NSUN2敲低或过表达ESCC细胞中mRNA上m5C的表达水平。
结合m5C MeRIP-seq和RNA-seq发现223个mRNA在NSUN2敲低后mRNA表达和m5C甲基化水平均显著下调,其中3个直接与YBX1结合(图5A)。有趣的是,我们注意到精胺氧化酶(SMOX)在ESCC组织中过表达(图5B)。IGV分析显示,NSUN2敲低后,KYSE150细胞中SMOX的m5C水平显著降低,并且SMOX的CDS中含有m5C位点,与YBX1的结合位点吻合(...
验证了NSUN2通过其m5C甲基化酶活性部分依赖性地促进乳腺癌进展。 通过收集患者的乳腺癌组织,并结合RNA-Seq和RNA-BS数据,筛选了m5C修饰位点,并在单碱基分辨率水平上鉴定出关键靶标HGH1。 (2)NSUN2/YBX1依赖于m5C调控HGH1 mRNA稳定性和表达的分子机制: 通过体内外实验阐明了NSUN2/YBX1依赖于m5C来调控HGH1 mRNA...
验证了NSUN2通过其m5C甲基化酶活性部分依赖性地促进乳腺癌进展。 通过收集患者的乳腺癌组织,并结合RNA-Seq和RNA-BS数据,筛选了m5C修饰位点,并在单碱基分辨率水平上鉴定出关键靶标HGH1。 (2)NSUN2/YBX1依赖于m5C调控HGH1 mRNA稳定性和表达的分子机制: 通过体内外实验阐明了NSUN2/YBX1依赖于m5C来调控HGH1 mRNA...
合作单位:内分泌学研究中心 Title(E):YBX1 promotes type H vessel–dependent bone formation in an m5C-dependent manner 联系我们 Q Q: 270105245 1511879086 465436937 邮箱: support@igenebook.com 地址:武汉市东湖高新区高新大道888号高农生物二期3A栋 ...
(3)RNA-Seq联合RNA-Bisseq筛选确定HGH1为乳腺癌m5C调控的潜在靶基因 由于NSUN2是负责RNA m5C修饰的主要甲基转移酶,研究人员分析了NSUN2促进乳腺癌(BC)进展机制:从5名临床患者中选择癌症和邻近组织样本,进行转录组分析(RNA-seq)和mRNA m5C亚硫酸盐测序(RNA-BS)。
m5C modification promotes YBX1 phase separation, which upregulates E2F1 expression. In ovarian cancer, NSUN2 and YBX1 are amplified and upregulated, and higher expression of NSUN2 and YBX1 predicts a worse prognosis for ovarian cancer patients. Moreover, E2F1 transcriptionally regulates the ...
同时,研究人员也提出了后续研究方向,比如进一步探究 YBX1 - DDX5 复合物在识别 m5C 修饰的 mRNA 中的潜在作用,以及 SENP1 介导 YBX1 去 SUMO 化的具体分子机制等。相信随着研究的不断深入,人类对结直肠癌的认识会越来越深刻,对抗癌症的手段也会越来越多。
36, 37 However, the YBX1-W65A mutant successfully rescued the phenotypes of YBX1-deficient leukemia cells, suggesting that the function of YBX1 as an m5C reader is not required for its effect on myeloid leukemia. Meanwhile, YBX1-W65A, but not ΔCSD, restored the expression of BCL2 and...
近日,云序生物助力郑州大学第一附属医院薛文华、任志刚、孙冉冉等在Advanced Science(IF=14.3)发表了题为“YBX1 Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via m5C-Dependent SMOX mRNA Stabilization”的研究成果。该研究发现YBX1促进ESCC细胞的增殖和转移,并且阐明了在ESCC发展中,m5C介导的癌基因激活的新...