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4、YASARA Structure: YASARA Dynamics+对接模块+同源模建模块 这个版本增加了分子对接模块,囊括了YASARA的所有可用模块,可以完成从同源模建到分子对接再到分子动力学研究,是一个综合分子模拟平台。 1.分子对接: YASARA的分子对接模块目前支持改进版的AutoDock, AutoDock Vina, FlexX(FlexX软件考虑诱导契合,但需要另外付...
玩转Yasara,轻松开启Yasara安装学习, 视频播放量 10、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 F27a1pgXKY, 作者简介 ,相关视频:pymol绘图教程-蛋白蛋白相互作用分析,PyMOL教程-小分子蛋白互作做图,超详细Yasara安装教程,Yasara轻松上手
最近发现YASARA可以偶连ORCA进行简单QM的计算,大家可以参考原始的文章以及User Guide进行探索,YASARA越来越强大了,欢迎大家共同交流。, 视频播放量 179、弹幕量 0、点赞数 6、投硬币枚数 6、收藏人数 6、转发人数 0, 视频作者 三鑫白兰地, 作者简介 ,相关视频:foldx计
分子模拟软件YASARA Herbal 新视界 北京协和医学院 药理学博士11 人赞同了该文章 在生物催化中,关于酶及其底物相互作用的结构知识补充并指导实验研究。关于酶或生物催化反应系统的结构知识可以通过计算技术产生,例如同源或分子建模。对于这种类型的计算工作,需要为蛋白质的分子建模开发的计算机程序。在这里,我们...
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YASARA分子动力学教程 酶催化分子动力学模拟Molecular dynamics of enzymatic catalysis YASARA混合体系的分子动力学模拟教程 By 临江仙YASARA是一款结合同源模建、分子对接以及分子动力学的综合性分子模拟软件。其功能强大毋庸置疑，具备了View、Model、Dynamics、Structure、NMR Module五个基本模块和一个扩展模块(YASARA/WHAT ...
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一、受体与配体准备 在Yasara中对dockxxx.yob进行操作,将receptor和ligand分别另存为: (receptorname)-(ligandname)-receptor.pdb和(receptorname)-(ligandname)-ligand.pdb; 二、分子动力学模拟文件准备 1. 在Yasara中打开(receptorname)-(ligandname)-ligand.pdb和(receptorname)-(ligandname)-receptor.pdb; ...