YASARA安装FoldX插件 Herbal 新视界 北京协和医学院 药理学博士 12 人赞同了该文章 YASARA安装FoldX插件的方法 1:进入YASARA网站 (yasara.org/products.htm#), 下载YASARA View (这个是唯一的免费版本)。下载需要教育邮箱,下载链接会在邮箱里提供,下载后直接拖进“应用程序”文件夹。
FoldX是一款基于经验力场的蛋白设计软件,它可以计算点突变的能量变化,运行丙氨酸扫描,蛋白质-蛋白质结合能以及蛋白质-DNA结合能计算以及同源模建。FoldX本身是基于命令行运行的,Switch lab开发出了基于YASARA的FoldX图形化界面,可以实现FoldX的绝大多数功能。 还有更重要的这款软件可以在移动设备运行,好玩程度媲美火爆的手...
霁月清风 上传于:2012-04-26 粉丝量:114 该文档贡献者很忙,什么也没留下。 下载此文档 更多相关文档 FoldXYasaraPluginManual 星级: 38 页 FoldXYasaraPluginManual 下载积分: 700 内容提示: User manual 文档格式:PDF | 页数:38 | 浏览次数:138 | 上传日期:2012-04-26 18:16:36 | 文档星级: ...
最近发现YASARA可以偶连ORCA进行简单QM的计算,大家可以参考原始的文章以及User Guide进行探索,YASARA越来越强大了,欢迎大家共同交流。, 视频播放量 179、弹幕量 0、点赞数 6、投硬币枚数 6、收藏人数 6、转发人数 0, 视频作者 三鑫白兰地, 作者简介 ,相关视频:foldx计
点击Analyze>FoldX>Stability of object进行突变后蛋白的稳定性计算。 117 补充:FlodX氨基酸突变 在弹出的对话框中任意双击一个对象,在此先双击“1crn”。 118 补充:FlodX氨基酸突变 计算完成下方命令行会显示计算结果,同样地,详细结果可以在foldx_cache中查询。
YASARA的下载和foldX的下载参考 FrontScience科研:YASARA安装FoldX插件 这两个就是我们下载好的 首先安装YASARA,直接双击会进行安装然后在同一层级的目录会出现YASARA的文件夹。 首次安装会自动运行YASARA程序,关闭即可。 然后安装foldX的插件。 注意点来了!应该很多朋友都会在解压foldX后发现少了个东西。对没错WIN下window...
一键同源建模,选择蛋白序列,即可构建得到蛋白模型,并在显式溶剂中进行优化结构 基于pH值计算分子的氢键网络,并自动考虑配体 加入新的力场YASARA和YASARA2,力场中添加了很多基于经验的部分,适于对蛋白结构更加精细的修饰和预测 可移植FoldX插件,计算点突变,丙氨酸扫描,结合能等...
请问为什么yasara使用foldx的position scan后,foldx运行一小会就报错:list index out of range哇 此外…显示全部 关注者1 被浏览1 关注问题写回答 邀请回答 好问题 添加评论 分享 暂时还没有回答,开始写第一个回答下载知乎客户端 与世界分享知识、经验和见解...