view=software https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-win64.zip 安装,解压即可 配置 添加环境变量 Path bin\prefetch.exe 序列号 bin\prefetch.exe 1. 2. bin\prefetch.exe --option-file C:\SRR_Acc_List.txt 1....
1.3 安装IBM Aspera connect 1.4 添加环境变量 右击此电脑,属性,高级系统设置,环境变量,将Aspera的安装路径加入到系统变量中的Path, Fig2.PNG Fig3.PNG 1.5 测试 在命令提示符中输入ascp 测试.png 2 安装sratoolkit 2.1 下载sratoolkit SRA Toolkit 下载windows版本的二进制包并解压。 2.2 添加环境变量 如图2和图...
# apt工具安装SRA Toolkit，提示“Configuring med-config”直接回车继续安装即可 sudo apt install sra-t...
有两个“path”,都要设置,且步骤相同。 双击“path”点击 ”新建“,然后将sratoolkit文件夹路径复制即配置完成。 4.运行cmd,打开sratool文件夹里面的bin,复制路径并输入bin\prefetch.exe-h查看软件能否正常运行。一般情况下第一次安装都会报错,显示错误原因没有配置,按照提示来输入vdb-config --interactive出现配置界...
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以 2、环...
首先安装sratoolkit 方法一:apt安装 首先:确保你的apt源是最新的,如果不是最新的清执行: apt-getupdate 其次:安装sratoolkit apt install sra-toolkit 再次:检查sratoolkit是否安装成功: prefetch -v 出现版本号或者命令参数则安装成功。 最终:当你不需要它的时候就可以卸载掉(作者比较惨,阿里云上的存储空间不太够...
1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit ...
造成我在linux环境下不能使用aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi.aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi,到这个界面根据系统下载你...
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以 ...
1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit ...