https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-win64.zip 安装,解压即可 配置 添加环境变量 Path bin\prefetch.exe 序列号 bin\prefetch.exe 1. 2. bin\prefetch.exe --option-file C:\SRR_Acc_List.txt 1.
下载适配Windows系统的程序版本安装包sratoolkit.3.1.1-win64.zip；
1.3 安装IBM Aspera connect 1.4 添加环境变量 右击此电脑,属性,高级系统设置,环境变量,将Aspera的安装路径加入到系统变量中的Path, Fig2.PNG Fig3.PNG 1.5 测试 在命令提示符中输入ascp 测试.png 2 安装sratoolkit 2.1 下载sratoolkit SRA Toolkit 下载windows版本的二进制包并解压。 2.2 添加环境变量 如图2和图...
一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi,到这个界面根据系统下载需要的sratoolkit,Windows 64位,于是就是下载倒数第二个。 2. 下载速度挺快的,之后得到一个压缩包,我们可以解压到指定的盘。 3.这个时候还不能直接用sratoolkit软件,还需要对电脑进行配置。 右击“此电脑”选择属性,选择“高级系统设置”...
运行bin\prefetch.exe -h,显示帮助信息,就是安装成功。 image.png 下载 从ncbi的sra数据库搜索想要的序列号 bin\prefetch SRRxxxxxx 等待下载完成就好 如果下载数据量过大 bin\prefetch --max-size 50G(比你的数据大一些)SRRxxxxxx 格式转换 双端(生成-1-2两个文件) ...
可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以 2、环境变量配置 这一步是我在操作时总是卡顿的地方,这里做详细介绍。流程是:右...
一、Windows系统 (1) 下载SRA ToolKit工具 访问NCBI官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),选择“Download”按钮跳转NCBI官网下载中心,在下载中心选择“Download Tools”按钮跳转工具下载中心,选择SRA Toolkit的“Download”下载按钮跳转GITHUB官网SRA Toolkit项目下载界面,选择“MS Windows 64 bit architecture”按钮(http...
但是最近下载数据,用windows版本的SRA Toolkit,啊~真香~~ 1、下载 image.png 然后解压缩。 2、安装 D:\1系统软件安装包\sratoolkit.2.11.0-win64\bin\vdb-config --interactive 会出现以下界面,有点懵逼。 image.png 但是一般软件的安装程序就是自定义安装还是默认安装。为了防止各种插件出错,保险起见,选择默认...
Toolkit下载NCBI序列数据。本文提供适配Windows系统的程序版本安装包sratoolkit.3.1.1-win64.zip和6个...
安装过程 1、从https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/toolkitsoft/中的NCBI SRA Toolkit latest release compiled binaries and md5 checksums下载安装包。 2、将安装包sudo mv sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz -t /opt 然后 cd /opt tar xzvf sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz ...