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本文涉及两种展现分子表面静电势分布的做法,第一种是196文中已经详细交代的,用Multiwfn的主功能12对静电势做定量分子表面分析导出表面顶点文件vtx.pdb,载入到VMD中显示出来,并根据vtx.pdb的B因子字段数据(对应静电势)来着色。第二种是类似《基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法》(http:...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布(缺点:步骤复杂,速度较慢,优点:功能强大)后面一声...
干净机子上直接装VMD 1.9.3不可能有这种问题。另外,强烈不建议把VMD装在默认目录下 ...
3-带极值点的静电势图(ESP)-作图过程 贱小贱0220 09:00 高斯View基础操作教学 厘梒儿吖 87052 05:27 Gaussian产生.wfn文件的过程 贱小贱0220 7543 13:26 gaussain绘制HOMO/LUMO轨道 混天佛陀 07:29 蔷薇芝士奶盖 30:35 Multiwfn+VMD静电势ESP计算 ...
07:27 Multiwfn+VMD绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图 为你推荐 自动连播 01:12 完美世界最新剧情,柳妈又又又又救了石昊一次,除此之外,为什么石昊还得感谢古圣子呢? 山海说漫 00:56 纯正魔龙血脉的阿宝,为何被龙皓晨斩杀?枫秀又为何会崩溃? 动漫新一 01:27 克系神明的三柱神都是谁?
迷糊如今社会创建的收藏夹默认收藏夹内容:零基础使用gaussian对等值面静电势图绘制及配合Multiwfn和VMD对高质量等值面静电势图的绘制教程,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
如果绘制某个体系的时候VMD里显示出了之前绘制过的其它体系,应当自行把VMD目录下相应的其它体系对应的pdb或cube文件删除。如果下文的透明的等值面显示得很诡异很难看,可能是显卡驱动和VMD不兼容而没能打开GLSL,尝试更新驱动或者用其它机子。 3 绘制单个分子的分子表面静电势图例子 下面以乙酰胺为例,分别绘制两种不...
Multiwfn(http://sobereva.com/multiwfn)有十分强大的静电势分析功能,按照《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》(http://sobereva.com/443)的做法还可以非常方便地结合VMD绘制效果很好的分子表面静电势图,此方法已经被大量文章所使用。此文中有一个脚本是ESPiso.bat,它会调用Mul...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布(缺点:步骤复杂,速度较慢,优点:功能强大)后面一声...