本文涉及两种展现分子表面静电势分布的做法,第一种是196文中已经详细交代的,用Multiwfn的主功能12对静电势做定量分子表面分析导出表面顶点文件vtx.pdb,载入到VMD中显示出来,并根据vtx.pdb的B因子字段数据(对应静电势)来着色。第二种是类似《基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法》(http:...
3417 4 4:49 App 使用Multiwfn+VMD绘制分子轨道图 6230 1 9:09 App RDG方法对比IRI方法分析弱相互作用 2603 8 7:59 App 7-带极值点的静电势(ESP)图-Origin绘制颜色标尺 586 4 2:28 App Multiwfn和VMD的安装过程 675 3 6:28 App 6-带极值点的静电势(ESP)图-标注静电势值 1873 3 3:52 ...
在VMD main窗口里面双击0的D标签使其变红,此时窗口内就只有分子表面和色彩刻度轴显示了出来。 按Alt+Printscreen键截屏,在photoshop里按Ctrl+N点击创建,然后Ctrl+V把截的图粘贴。此时图像大小正好和VMD窗口大小完全一致。 在VMD main窗口双击1和4的D标签使其变红,从而只让分子结构显示出来,将背景改为绿色。 然后...
本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和photoshop作分子表面静电势图既不比使用Gaussview快,步骤也比它复杂,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部...
如果直接用《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图》一文里的ESPiso....
3-带极值点的静电势图(ESP)-作图过程 贱小贱0220 09:00 高斯View基础操作教学 厘梒儿吖 87052 05:27 Gaussian产生.wfn文件的过程 贱小贱0220 7543 13:26 gaussain绘制HOMO/LUMO轨道 混天佛陀 07:29 蔷薇芝士奶盖 30:35 Multiwfn+VMD静电势ESP计算 ...
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）http://sobereva....
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 文/Sobereva 2013-Jul-28 1 前言 分子表面静电势图经常在文献中出现,不同表面区域静电势大小通过不同颜色展现,使分子表面上静电势的分布一目了然。分子表面一般都用Bader定义的范德华表面, e/Bohr^3的等值面。只要提供所需的输入数据,这种图在许多程序中都可以作...
分子表面一般都用Bader定义的范德华表面,即电子密度为0.001 e/Bohr^3的等值面。只要提供所需的输入数据,这种图在许多程序中都可以作。本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和Photoshop作分子表面静电势图步骤相对步骤较多,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地...
本文涉及两种展现分子表面静电势分布的做法,第一种是196文中已经详细交代的,用Multiwfn的主功能12对静电势做定量分子表面分析导出表面顶点文件vtx.pdb,载入到VMD中显示出来,并根据vtx.pdb的B因子字段数据(对应静电势)来着色。第二种是类似《基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法》(http...