VASP-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) vtst脚本包 一些用perl语言写的脚本,不错的处理neb计算的工具箱。详情请进:http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts.html 后面所有后缀名为pl的脚本都来自这里。 计算步骤 1. 初末态结构优化 建立两个文件夹ini(初态的意思),fin(末态),每个文件夹放入vasp计算必...
(1)要插入足够多的点才可能找到近似的过渡态,计算资源消耗极大。 (2)因为珠子不可能到鞍点的顶端,计算出的过渡态能量总是被低估的,又因为本来LDA,GGA泛函就经常低估过渡态能量,所以误差叠加,此方法不太准确。 所以后来,G. Henkelman(VTST的开发者...
3、准备输入文件,修改INCAR 在NEB文件夹(注意是有00 01等这几个数字文件夹的NEB文件夹,而不是有POSCAR的00 01等小文件夹!!!)里放KPOINTS/INCAR/POTCAR这几个输入文件,和ini和fin里用的参数保持一致。接下来修改INCAR,以能适用于NEB计算。 在INCAR中添加这几行: 其中IBRION和POTIM有可能是之前INCAR里会设置的,...
NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG为合理的值即可,在前期试算过程中设置的值为0.02 eV/Å; NEB相关的关键词含义: LCLIMB=.TRUE. #通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知...
但是对于NEB的这些改进并没有包含在VASP软件包中，我们需要通过VTST脚本来实现(需要重新编译支持CI-NEB的VASP)。NEB方法和CI-NEB方法的对比 下面讲解一下如何用CI-NEB方法计算过渡态。1.首先我们需要对初猜的初态末态结构进行优化，这里建议设置IBRION = 2(建议所在文件夹建议命名为ini和fin)。优化之后一定要确定初...
在化学动力学研究中，NEB方法（或称CI-NEB方法）被广泛用于计算过渡态。此方法基于Eyring方程，利用势垒与温度决定反应速率的原理。NEB方法的核心思想是通过在初始态与最终态之间插入一系列过渡态结构，模拟分子在反应路径上的变化过程，最终找到从初始状态到最终状态的最低能量路径。在VASP-vtst计算平台中，...
用CP2K快两个数量级，SCF一轮只需要几秒钟
以下NEB计算的方法只介绍vtst tool版本的vasp NEB计算步骤如下：1. 准备好初末构型的vasp文件: is....
⼀. NEB 运⾏结果 在机器上已编译好vtstcode，以lscs-6th H 在Ni(001)表⾯扩散过渡态寻找为例，说明vasp neb的计算结果。1)输⼊ INCAR，KPOINTS，POTCAR在上层⽬录 INCAR：SPRING=-5 IMAGES=4 POTIM=0.1 IBRION=2 这样⾃动使⽤VTST CINEB⽅法计算过渡态，但是使⽤VASP 的CG算法 2)运⾏...
NEB(CENB)方法的学习 http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/介绍了安装CNEB扩展包的安装步骤，以及所有处理输出数据的脚本的使用说明。简单吧，这就是安装NEB的扩展包的过程！为了更直观的学会使用NEB方法，下面有个例子，做两遍就会了。至于NEB方法的原理的文章看一遍，知道个大概就行了。毕竟我们是搞计算使用...