在UniProt主页的搜索框中,输入你感兴趣的蛋白质的名称(如“Tubulin”)或其他相关信息(如功能描述、物种名等)。 在搜索结果中找到对应的蛋白质条目: 在搜索结果页面中,浏览列出的多个蛋白质条目,找到你感兴趣的目标蛋白。 查看蛋白质条目的UniProt ID: 点击进入目标蛋白的详细信息页面。在目标蛋白的详细信息页面中...
各种ID转换基因Symbol的小程序 (Ensembl gene ID, Ensembl transcript ID, Gene ID, GB acc) Jingle进哥 8577 2 00:54 二: 基因id一键转换 学术渣在欧洲 5589 1 13:18 中药复方网络药理学:3.1 Uniprot数据库的简介及介绍 誉川中医药 22.9万 344 ...
通过Uniprot ID转化蛋白质名称,可以快速方便地获得蛋白质的标识名称。以下是一些常见的转化方法: 1. Uniprot数据库的查询:通过访问Uniprot数据库,用户可以输入Uniprot ID来获取蛋白质的名称和其他相关信息。该数据库不仅包含了已知的蛋白质信息,还包括了未经验证的蛋白质信息,为科学家们提供了丰富的资源。 2.在线工具...
网络药理学 Part2--成分靶点数据的处理(SWISS、Pharmapper)数据的筛选和uniprot ID的转换 7507 6 1:40:01 App uniprot,omim,drugbank,cytoscape使用 2283 -- 0:38 App 批量下载小分子 3884 -- 5:12 App 在线批量快速Ensembl基因id转symbol,NCBI entrez geneid转symbol 2074 -- 7:28 App F05.蛋白名转化...
蛋白质组学研究:UniProt ID 是蛋白质组学研究中常用的标识符,尤其在 KEGG 和 GO 富集分析以及代谢组学研究中具有重要意义。 如何使用 UniProt ID 检索蛋白质信息:在 UniProt 官网(https://www.uniprot.org)的搜索框中输入 UniProt ID,可以快速获取该蛋白质的详细信息。
先上代码，下面的程序是提取drug id ，drug name，type，及对应靶点的uniprot id，target name，存入...
第一步，准备蛋白质序列数据 在获取蛋白质UniProtID之前，需要先准备好蛋白质序列数据。通常情况下，蛋白...
Python 代码提取 drug id、drug name、type 及靶点的 uniprot id 和 target name，输出为 items.csv 文件。JSON 文件结构包含 "drugbank" 顶层键，下一层为 "drug"，包含所有药品信息。每个 drug 包含多个标签，如 name、id、targets 等。通过遍历 JSON 结构并提取相关标签，即可获取所需数据。
在UniProt数据库中,每个蛋白质条目都可能关联有一个或多个GO条目,这些GO条目描述了该蛋白质的功能和参与的生物过程。 要实现UniProt ID和GO条目之间的对应,可以使用多种生物信息学工具和资源,如UniProt网站、Bioconductor包中的函数等。通过输入UniProt ID,可以检索到与该蛋白质相关的所有GO条目,从而了解其在生物体中...
1. 打开uniprot.org/ 选择Retrieve/IDmapping 2. 输入所要查询的Uniprot ID 选择From UniprokKB AC/ID To Gene name Submit 3. 下载结果发布于 2023-12-31 21:08・IP 属地天津 内容所属专栏 网络药理学知识分享 网药文章分享、思路、工具、绘图和数据库等 订阅专栏 ...