先上代码，下面的程序是提取drug id ，drug name，type，及对应靶点的uniprot id，target name，存入ite...
第二步，运用现有工具批量获取蛋白质UniProtID 在获取蛋白质UniProtID时，可以通过现有的在线工具来辅助完...
在UniProt数据库中,每个蛋白质条目都可能关联有一个或多个GO条目,这些GO条目描述了该蛋白质的功能和参与的生物过程。 要实现UniProt ID和GO条目之间的对应,可以使用多种生物信息学工具和资源,如UniProt网站、Bioconductor包中的函数等。通过输入UniProt ID,可以检索到与该蛋白质相关的所有GO条目,从而了解其在生物体中...
通过Uniprot ID转化蛋白质名称,可以快速方便地获得蛋白质的标识名称。以下是一些常见的转化方法: 1. Uniprot数据库的查询:通过访问Uniprot数据库,用户可以输入Uniprot ID来获取蛋白质的名称和其他相关信息。该数据库不仅包含了已知的蛋白质信息,还包括了未经验证的蛋白质信息,为科学家们提供了丰富的资源。 2.在线工具...
uniprotID convent gene name, 视频播放量 16、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 Herbal新视界, 作者简介 自在鹏飞～,相关视频:李在峰八段锦全套教学跟练视频,28天养元活血太极营站桩全套带练高清课程,26岁小姑娘手淫九年,舌苔剥落
## uniprotswissprot entrezgene_id external_gene_name ## 1 P01709 NA IGLV2-8 ## 2 P01871 NA IGHM ## 3 P02042 3045 HBD ## 4 P02671 2243 FGA ## 5 P02679 2266 FGG ## 6 P04278 6462 SHBG Ensemble ID 转换 EnsembleID <- c("ENSG00000198804", "ENSG00000198712", "ENSG00000198938",...
uniprot有对应的id。打开uniprot界面，在右下角找到设置，ID显示里就能看到对应的id号了。
因为课题需要,得根据uniprot ID提取对应的sequence,因为数据量较大,故选择利用python进行爬取,将流程和结果记录如下,若有不对欢迎指正。 编辑器是jupyter (其他编辑器如pycharm也行) ,所需的库有urllib,bs…
为了方便进行统一id的转换,我们将以uniprot的蛋白id作为所有数据库的参考id。而取这一参考id的原因则是因为uniprot数据库应该是目前已知的包含蛋白信息最全的数据库了。 至于需要转换的数据库则太多啦,因此,本文将以最常见的蛋白互作数据库STRING数据库为例,介绍如何进行id转换。