Uniprot ID转换通常指的是将Uniprot数据库中的蛋白质唯一标识符(Uniprot ID)转换为其他类型的标识符,如基因名、Ensembl ID、RefSeq ID等。以下是一个详细的步骤指南,帮助你理解并实现Uniprot ID的转换: 1. 明确Uniprot ID转换的目标格式 首先,你需要明确你想将Uniprot ID转换为什么样的标识符。例如,你可能想将Unip...
1. UniProt数据库的使用 2. UniProt ID 转换成Gene ID 3. 数据的整理 4. Vlookup函数的使用 展开更多 知识 校园学习 网络药理学 UniProt ID 基因名 Uniprot数据库 CytoScape作图 靶点-成分网络 中药 8.2 Cytoscape构建药物-成分-靶点基因网络操作步骤(1)(无脚本) ...
## 6 ensembl_peptide_id_version Protein stable ID version feature_page 4. 开始转换 uniprot ID 转成 proteins <- c("P02671", "P02679", "P01871", "Q96PD5", "P04278", "P02042", "P10745", "P07384", "P06576", "P01709", "P07477") ids_mapping <- getBM(mart=ensembl_hsapiens,=...
第一步:登陆Uniprot网站,网址:http://www.uniprot.org/, 点击“Retrieve/IDmapping ”. 第二步:填写你需要转换的基因名称,选择转换格式,如From“Gene name”To“UniprotKB”,选择相应的物种,在Organism中选择。运行“Submit”。 第三步:跳出“UniprotKB results”界面显示查询的结果(注:可能出现部分基因查询不到,也...
在From database中选择我们的输入数据格式是 UniprotKB AC/ID 在To database中选择我们需要转换的 PDB 点击Map进入工作流程 点击Completed进入工作结果页面 这里显示了匹配的 PDB id,因为一个 蛋白质ID 可能对应多个PDB ID,因此转换结果较多。 点击Download进行下载 ...
🔍 基因转换步骤: 1️⃣ 访问UniProt官网:在搜索引擎中搜索“UniProt”,进入官网后,点击“Retrieve/ID mapping”。 2️⃣ 输入交集基因:在空白处输入交集基因,然后在下拉栏中选择“Gene name”和“UniProtKB”,输入“homo”并选择“homo sapiens(Human)”,最后点击“Submit”。
为了方便进行统一id的转换,我们将以uniprot的蛋白id作为所有数据库的参考id。而取这一参考id的原因则是因为uniprot数据库应该是目前已知的包含蛋白信息最全的数据库了。 至于需要转换的数据库则太多啦,因此,本文将以最常见的蛋白互作数据库STRING数据库为例,介绍如何进行id转换。STRING数据库简介:在分子生物学中,STRING...
网站地址:https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 点击进去之后你会发现该网站支持各种ID转换,支持上传文件和直接...
首先,将您保存有Uniprot ID的文本文件上传到ncbi的Sequence Retrieval System(SRS)服务器。然后,将SRS的搜索结果导出为FASTA格式的文件,该文件将包含与Uniprot ID对应的蛋白质序列。 第三步,使用BioMart进行基因转换。BioMart是一个功能强大的生物信息学工具,可以进行生物序列和注释信息的转换和查询。打开BioMart网站(...
uniprot基因名转换方法 1. 打开uniprot网页: https://www.uniprot.org/ 2. 点击Retrieve/ID mapping 3. 输入要转换的基因名称,转换成uniprot基因名称,注意要填写正确物种名。点击submit。 4.点击Reviewed 5.点击Download,EXCEL,非压缩文件,导出经转换的基因名,完成。