你可以使用这个API来查询Uniprot ID并获取对应的基因名。 3. 使用API或查询语句将Uniprot ID转换为对应的基因名 下面是一个Python代码示例,它使用requests库来发送HTTP请求到Uniprot API,并解析返回的JSON数据以获取基因名: python import requests def get_gene_names(uniprot_ids): gene_names = {} for uniprot_...
🔍 基因转换步骤: 1️⃣ 访问UniProt官网:在搜索引擎中搜索“UniProt”,进入官网后,点击“Retrieve/ID mapping”。 2️⃣ 输入交集基因:在空白处输入交集基因,然后在下拉栏中选择“Gene name”和“UniProtKB”,输入“homo”并选择“homo sapiens(Human)”,最后点击“Submit”。 3️⃣ 选择Reviewed和Human...
## 2 ensembl_gene_id_version Gene stable ID version feature_page ## 3 ensembl_transcript_id Transcript stable ID feature_page ## 4 ensembl_transcript_id_version Transcript stable ID version feature_page ## 5 ensembl_peptide_id Protein stable ID feature_page ## 6 ensembl_peptide_id_version ...
uniprotID convent gene name, 视频播放量 20、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 Herbal新视界, 作者简介 自在鹏飞～,相关视频:小一熟了 展示绝活口技 超激烈的口腔音陈不过10秒缴械,第4讲练课视频加乘,1+1=3?,亚男白女结婚2025.1
第一步:登陆Uniprot网站,网址:http://www.uniprot.org/, 点击“Retrieve/IDmapping ”. 第二步:填写你需要转换的基因名称,选择转换格式,如From“Gene name”To“UniprotKB”,选择相应的物种,在Organism中选择。运行“Submit”。 第三步:跳出“UniprotKB results”界面显示查询的结果(注:可能出现部分基因查询不到,也...
uniprot2gene$Symbol <- str_split(uniprot2gene$`Gene Names`, pattern =" ", n =2, simplify =T)[,1] uniprot2gene["P14678",] id2name <- uniprot2gene[,c(1,3)] head(id2name) id2name["P14678",] 现在有了这个对应关系,那是用uniprot id进行功能富集分析就不在话下了!
OX=9606:Organism Taxonomy,也就是物种分类数据库Taxonomy ID GN=POU5F1:Gene name,基因名为POU5F1 PE=1:Protein Existence,蛋白质可靠性,对应5个数字,数字越小越可靠: 1:Experimental evidence at protein level 2:Experimental evidence at tranlevel
gene symbol转换为protein ID: 参考资料:https://www.cnblogs.com/wangshicheng/p/11171058.html 工具网站:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php David数据库的详细用法说明: https://david.ncifcrf.gov/helps/functional_annotation.html#summary ...
...UniProt ID就是Entry,是UniProt的给每个蛋白质赋予的独一无二的ID号,而Entry name通常是基因名称加物种名称。 ?...KEGG可参考文章【KEGG数据库使用及通路分析教程】,PDB数据库参考文章【生物数据库】。...二.常见的ID转换在线工具 1.Uniprot ID mapping 可以很方便地把 ID 转换为其他 ID 类型, 所包含的...
Entry:是Uniprot给每个蛋⽩质赋予的独⼀⽆⼆的ID Entry name:是蛋⽩ID的简要名字 Protein names:蛋⽩质的名字 Gene names:编码这个蛋⽩的Gene名字 Organism:蛋⽩质的种属来源 Length:氨基酸长度 UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息 数据库高级检索及数据条目注释信息 姓名 学号 编号 日期 1. 人...