GWAS ROUND1:https://docs.google.com/spreadsheets/d/1b3oGI2lUt57BcuHttWaZotQcI0-mBRPyZihz87Ms_No/edit#gid=275725118 首先针对UKB数据申请,你需要有一个Principal Investigator (PI) ,只有他才有群里进入AMS系统,普通用户进入首页和登陆后从AMS进入界面是不同的,可以看到showcase的差异。一般而言,一个项目组...
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳，最出名的当属IEU OPEN GWAS（https://gwas.mrcieu.ac.uk/）。使用IEU调取UKB-gwas比较简单，直接搜索表型，然后UKBB的也会被搜索出来，通过ID直接调取就好了，IEU已经对数据重新进行了质控和检验，所需要的变量都应经存在。GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(https://www...
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳,最出名的当属IEU OPEN GWAS(gwas.mrcieu.ac.uk/)。 使用IEU调取UKB-gwas比较简单,直接搜索表型,然后UKBB的也会被搜索出来,通过ID直接调取就好了,IEU已经对数据重新进行了质控和检验,所需要的变量都应经存在。 GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(ebi.ac.uk/gwas/search?
UKBB数据集下载流程(第二节) 2022 - NG - Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort 这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the ...
UK Biobank 是一个大规模人群前瞻性队列研究，收集了来自英国的50万参与者的信息。其公开的GWAS数据被广泛用于科学研究。其中，IEU OPEN GWAS 和 GWAS Catalog 是两个主要的数据仓库，分别提供了UKB-gwas数据的访问。使用IEU OPEN GWAS 数据库调取UKB-gwas 数据非常便捷。只需搜索感兴趣的表型，数据库...
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳,最出名的当属IEU OPEN GWAS(https://gwas.mrcieu.ac.uk/)。 使用IEU调取UKB-gwas比较简单,直接搜索表型,然后UKBB的也会被搜索出来,通过ID直接调取就好了,IEU已经对数据重新进行了质控和检验,所需要的变量都应经存在。
1522 -- 1:03:00 App 孟德尔随机化之pan_ukbb数据转化 3701 1 1:02 App 孟德尔随机化之GWAS catalog下载的关联SNP转化 2881 -- 21:01 App 孟德尔随机化之LDSC和MRlap分析 1311 1 2:51 App 孟德尔随机化之可药物性基因数据获取 2625 2 29:49 App easyMR之药物靶向孟德尔随机化流程 1486 -- 10...
汇总数据-NEALE LAB PART 03 1. 基本信息 哈佛医学院的团队,获取了UKBB的个体数据,进行大型的GWAS分析,不可在线查看,提供了下载链接, 可自行down到本地后处理。 2. 网站链接 http://www.nealelab.is/ 两个可供使用的数据来源:2018和2020 ①2018
来自nature的ukb的21个社会行为特征数据 2023年7月一篇在 Nature Human Behaviour 期刊发表的研究指出,当前的UKB数据用于MR分析时,可能忽略了社会行为学对GWAS的影响。许多常研究的因素会影响研究参与 - 医工科研-孟德尔随机化于20240525发布在抖音,已经收获了1518个喜
UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳,最出名的当属IEU OPEN GWAS(https://gwas.mrcieu.ac.uk/)。 使用IEU调取UKB-gwas比较简单,直接搜索表型,然后UKBB的也会被搜索出来,通过ID直接调取就好了,IEU已经对数据重新进行了质控和检验,所需要的变量都应经存在。