UKBB是一个大型生物医学数据库和研究资源,包含来自50万英国参与者的深入的基因和各类表型的信息。该数据库定期增加额外的数据,可供对最常见和危及生命的疾病的研究。UKBB从2006年到2010年在英格兰、苏格兰和威尔士招募了大约50万人(预期年龄40-69岁,45.6%为男性,94%自报欧洲血统)。参与者完成了各种身体评估、生物测量...
UKBB-gwas目录保存在谷歌的table中，地址(https://docs.google.com/spreadsheets/d/1kvPoupSzsSFBNSztMzl04xMoSC3Kcx3CrjVf4yBmESU/edit#gid=227859291)我们可以看到，一个表型更具数据类型，性别做了6次GWAS分析，这是UKB原始库最大的特点，当我们的疾病和性别有关系时候那么选择UKB原始数据再好不过。性别很好理解...
ukb平台预装了plink,因此我们只需要借助swiss-army-knife 软件使用即可 基本逻辑是将脚本编辑好,复制给run_merge 然后在swiss-army-knife中使用参数-icmd 将run_merge传参进去即可运行。 我这里做的工作是将22条常染色体的bfile文件合并成一个大的bfile文件,后面去做PRSice方便。 #!/bin/sh run_merge="cp /mnt/...
更多医学科研干货,欢迎持续关注~, 视频播放量 1593、弹幕量 0、点赞数 16、投硬币枚数 0、收藏人数 7、转发人数 0, 视频作者 解螺旋官方频道, 作者简介 医生科研成长平台,老谈酸菜免费带你入门医学科研!,相关视频:为什么说医学生要用NewIdea,而不是DeepSeek?,【简介
5.其实在UKBB赋予权限后,掌握上述基因型表型获取方式,基本就可以完全拿到UKBB原始数据 我目前手边工作忙完,可能会接入UKBB原始数据质控等项目,我会继续更新。
The positions in the table below reflect the University Children's Hospital Basel (UKBB)'s position overall, domestically, within their sector, and in various subject areas based on their Share. Each position links to the corresponding table where University Children's Hospital Basel...
孟德尔随机化研究中的UKBBgwas详解如下：UKBBgwas数据简介：UK Biobank是一个大规模人群前瞻性队列研究，收集了来自英国的50万参与者的信息。UKBB的GWAS数据被广泛用于科学研究，以评估特定基因变异与疾病风险之间的因果关系。主要数据仓库：IEU OPEN GWAS：提供了UKBgwas数据的便捷访问，研究者只需搜索感兴趣...
孟德尔随机化是一种统计方法，用于评估特定基因变异与疾病风险之间的因果关系。本文将详细解析UK Biobank（UKBB）GWAS数据，为孟德尔随机化研究提供具体指导。UK Biobank 是一个大规模人群前瞻性队列研究，收集了来自英国的50万参与者的信息。其公开的GWAS数据被广泛用于科学研究。其中，IEU OPEN GWAS 和 GWAS...
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UKBB数据下载流程(第一节) UKBB数据集下载流程(第二节) 2022 - NG - Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort 这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。