UKB-PPP pQTL数据非常不友好，下载下来是不能直接分析的，因为数据按照染色体分开存放的，更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID，根本没有办法分析。既然下载好的数据是分开的，又没有SNP ID，想进行数据分析必须进行数据合并和SNP ID转换，这个就麻烦了，因为这些操作需要大量的硬盘空间、强大的CPU、内存，普通电脑根本...
现在来看看这个问题,首先我们可以百度一下UKB-PPP pQTL找到下载的网址,具体如下:https://www.synapse.org/Synapse:syn51364943/wiki/622119 登录后可查看图片 需要用邮箱注册一个账号,然后登录进去,点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方: 登录后可查看图片 登录后可查看全文...
UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。 既然下载好的数据是分开的,又没有SNP ID,想进行数据分析必须进行数据合并和SNP ID转换,这个就麻烦了,因为这些操作需要大量的硬盘空间、强大的CPU、内存,普通电脑根本无从...
UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。 既然下载好的数据是分开的,又没有SNP ID,想进行数据分析必须进行数据合并和SNP ID转换,这个就麻烦了,因为这些操作需要大量的硬盘空间、强大的CPU、内存,普通电脑根本无从...
自己可以下载自己需要的pqtl数据,也可以全部下载来,不过全部下载下来是比较困难的,因为这里有2940个文件,搞下来就高达2T数据,没有稳定的、高速的网络根本行不通。 UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。