10月份Nature发布了UK biobank的蛋白质组学pQTL数据数据(UKB-PPP)原文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-023-06592-6数据质量依然非常好,有多祖先的数据,每种数据里有2940个蛋白的pQTL,下载链接:https://www.synapse.org/...
但是该数据下载非常麻烦,需注册,登录,专门的软件下载,还有网速和电脑要求,未解压缩时大约2T,下载后需要进行数据清洗后方能使用!普通的笔记本电脑及个人电脑难以完成该操作!在2023年12月医工科研团队就将 UKB - PPP 数据上传到云上 GWAS 了,目前已经有学员使用该数据顺利发表7分的 SCI 啦!
UKB-PPP使用Olink平台表征了 54,219 名UKB参与者的血浆蛋白质组学特征,并收集了2,923种蛋白质的数据。 2. 数据下载链接 https://www.synapse.org/#!Synapse:syn51365301 3. 数据来源文献 Sun BB et al. Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank. Nature. 2023 Oct;622(79...
ukbppp东亚蛋白组学数据 #医工科研云上GWAS #医工科研kim老师 @抖音小助手 @抖音创作者中心 - 孟德尔随机化课程客服于20240613发布在抖音,已经收获了241个喜欢,来抖音,记录美好生活!
,该方案将使用超级便捷的方法实现多样化数据的快速分析!将彻底不再受限于IEU数据库的502报错,不再受限于芬兰、UKB数据下载缓慢,难以使用的问题! 其中就包含对这一个UKB-PPP最新数据的使用,大家无需繁琐的下载和处理过程,可以通过先锋计划直接快速提取该数据用于孟德尔随机化分析以及GWAS相关研究的分析,可以支持顺式反式...