需要用邮箱注册一个账号，然后登录进去，点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方：自己可以下载自己需要的pqtl数据，也可以全部下载来，不过全部下载下来是比较困难的，因为这里有2940个文件，搞下来就高达2T数据，没有稳定的、高速的网络根本行不通。UKB-PPP pQTL数据非常不友好，下载下来是不能直接分析的...
现在来看看这个问题,首先我们可以百度一下UKB-PPP pQTL找到下载的网址,具体如下:https://www.synapse.org/Synapse:syn51364943/wiki/622119 登录后可查看图片 需要用邮箱注册一个账号,然后登录进去,点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方: 登录后可查看图片 登录后可查看全文...
1.下载解压合并和转化SNP,暴露数据直接拿去用[118.UKB_PPP数据(pQTL)下载和暴露处理(M80)] 52 0 01:55 App 06.筛选pQTL孟德尔随机化阳性结果【英国UKB_PPP数据1923个蛋白(pQTL)孟德尔随机化(生信私学M81)】 955 0 02:50 App 04.获取暴露和结局数据【药物靶点孟德尔随机化(共定位/eQTL)】 51 0 02:12 ...
10月份Nature发布了UK biobank的蛋白质组学pQTL数据数据(UKB-PPP)原文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-023-06592-6数据质量依然非常好,有多祖先的数据,每种数据里有2940个蛋白的pQTL,下载链接:https://www.synapse.org/...
UKB-PPP使用Olink平台表征了 54,219 名UKB参与者的血浆蛋白质组学特征,并收集了2,923种蛋白质的数据。 2. 数据下载链接 https://www.synapse.org/#!Synapse:syn51365301 3. 数据来源文献 Sun BB et al. Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank. Nature. 2023 Oct;622(79...
但是该数据下载非常麻烦,需注册,登录,专门的软件下载,还有网速和电脑要求,未解压缩时大约2T,下载后需要进行数据清洗后方能使用!普通的笔记本电脑及个人电脑难以完成该操作!在2023年12月医工科研团队就将 UKB - PPP 数据上传到云上 GWAS 了,目前已经有学员使用该数据顺利发表7分的 SCI 啦!
ukbppp东亚蛋白组学数据 #医工科研云上GWAS #医工科研kim老师 @抖音小助手 @抖音创作者中心 - 孟德尔随机化课程客服于20240613发布在抖音,已经收获了245个喜欢,来抖音,记录美好生活!
自己可以下载自己需要的pqtl数据,也可以全部下载来,不过全部下载下来是比较困难的,因为这里有2940个文件,搞下来就高达2T数据,没有稳定的、高速的网络根本行不通。 UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。
自己可以下载自己需要的pqtl数据,也可以全部下载来,不过全部下载下来是比较困难的,因为这里有2940个文件,搞下来就高达2T数据,没有稳定的、高速的网络根本行不通。 UKB-PPP pQTL数据非常不友好,下载下来是不能直接分析的,因为数据按照染色体分开存放的,更惨的就是没有提供rs开头的SNP ID,根本没有办法分析。
现在来看看这个问题,首先我们可以百度一下UKB-PPP pQTL找到下载的网址,具体如下:https://www.synapse.org/Synapse:syn51364943/wiki/622119 登录后可查看图片 需要用邮箱注册一个账号,然后登录进去,点击Files就可以进入如下的界面就可以找到了下载的地方: 登录后可查看图片 登录后可查看全文...