Trap-seq基于Ribo-seq技术,通过利用核糖体作为“标记”来捕获并分离由核糖体翻译的mRNA。在Trap-seq实验中,首先通过转化目标细胞或组织,使其表达核糖体上特定的融合蛋白,这些蛋白与核糖体上的蛋白有一定亲和性,并且可以用亲和纯化技术进行高效分离。然后,用亲和纯化技术富集核糖体-融合蛋白- mRNAs复合物,并用RNase酶降...
该研究通过比较早期缺镁情况下基因转录水平(RNA-seq)和翻译水平(TRAP-seq)的差异,鉴定出一些仅在翻译水平响应镁供给变化的新基因。进一步结合遗传学筛选,发现一个碱性亮氨酸拉链b-ZIP家族转录因子HY5,两个钙离子转运体CAX1和CAX3,和一...
应用名称:QQ音乐|开发者:深圳腾讯计算机系统有限公司 版本号14.1.0|隐私政策|服务协议|产品功能|应用权限 播放队列(1首) TRAP SEQ BEAT IV (feat. CHUCK IRVIN & YK BENZ) (INSTRUMENTAL)-BEATDEALERS LLC/Chuck Irvin/YK Benz关闭 QQ音乐 应版权方要求不能免费播放,可开通付费音乐包后畅享 我知道了...
TRAP-Seq Targeted Purification of Polysomal mRNA Targeted purification of polysomal mRNA (TRAP-Seq) maps translating mRNAs under various conditions(Jiao et al., 2010). In this method, tagged ribosomal proteins are expressed in cells. The tagged ribosomal proteins are purified and the RNA isolated....
Translational changes induced by acute sleep deprivation uncovered by TRAP-SeqGene expressionHippocampusMemoryRNARibosomeSleep deprivationTRAPSleep deprivation is a global health problem adversely affecting health as well as causing decrements in learning and performance. Sleep deprivation induces significant ...
用雷帕霉素处理 EGFP-RPL19 敲入细胞,对总 mRNA 和 TRAP mRNA 进行 RNA-Seq 分析。KEGG 富集分析显示,雷帕霉素影响多个途径,证实了 mTOR 是雷帕霉素的内源性靶点,这表明 RPL19-TRAPKI-Seq 系统在小分子药物机制研究中可行且有效,能减少背景干扰。
本研究采用MeRIP- seq、荧光素酶报告基因实验、MeRIP等方法从RNA甲基化角度阐明NFATc1对破骨细胞的调控机制。此外,外泌体上EphA2过表达是靶向递送METTL14到破骨细胞的有效生物学方法。本研究表明外泌体释放的METTL14可以通过增加NFATc1的m6A甲基化水平来抑制破骨细胞,帮助绝经后骨质疏松患者保留骨量,避免引发颌骨坏死...
CapTrap-Seq: A platform-agnostic and quantitative approach for high-fidelity full-length RNA sequencing Silvia Carbonell-Sala1, Tamara Perteghella1,2, Julien Lagarde1,3, Hiromi Nishiyori4,5, Emilio Palumbo1, Carme Arnan1, Hazuki Takahashi4,5, Piero Carninci4,5, Barbara Uszczynska-Ratajczak1...
(2 animals pooled per sample), we used an unbiased RNA sequencing approach and the MUGQIC RNA-seq pipeline [45] to identify and analyze differential gene expression. Using a stringent criterion for significance (False Discovery Rate (FDR) < 0.05) to avoid false positives, we found ...
的快速发展产生了大量RNA-Seq转录组数据,这给计算生物学领域带来了新的挑战。注释完整的参考基因组的使用场景十分有限,为了研究没有完整参考基因组的生物转录组数据,从头组装转录组成为当下研究的热点。 今天要给大家分享的是一篇发表在Nucleic Acids Res上的文章“TRAPID 2.0: a web application for taxonomic and fu...