The cancer genome atlas(TCGA)数据库储存20多种癌症的基因组数据,作为生信喵少不了要下载上面的数据来分析。写篇文章介绍一下,也加深自己的印象。 TCGA收录的了很全面的癌症基因组数据,包括突变,拷贝数变异,mRNA表达,miRNA表达,甲基化数据等 这些数据可分为三个级别: level-1: 原始的测序数据(fasta,fastq等) ...
9.3.1.1.TCGA(The Cancer Genome Atlas) The Cancer Genome Atlas (TCGA), a landmark cancer genomics program, molecularly characterized over 20,000 primary cancer and matched normal samples spanning 33 cancer types. This joint effort between NCI and the National Human Genome Research Institute began i...
例 句 During the last few years, comparing genomic data of most cancer cell lines has corroborated this statement and those that were observed studying the tumoral tissue equivalents included in the The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. 在过去的几年里,通过比较大多数癌症细胞系的基因组数据,证...
官方网址[2]:https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga; 数据库入口网址: https://portal.gdc.cancer.gov/ https://www.cell.com/pb-assets/consortium/pancanceratlas/pancani3/index.html 数据来源:TCGA项目组; 原发性癌症:经分子特征分析验证的,超过20,000的原...
今天阅读了一篇较早的TCGA项目组在2013年发表于Nature的评论文章,题目为The Cancer Genome Atlas Pan-Cancer analysis project。虽然文章有一点老,但出于对TCGA的了解与理解,还是很有学习意义。 TCGA已经描绘并分析了大量的人类癌症多组学数据,因此可以整合相应数据,挖掘跨癌症类型的分子特征,并为临床治疗提供帮助。
The Cancer Immunome Atlas:肿瘤免疫图谱数据库,欢迎关注”生信修炼手册”!肿瘤免疫疗法在多种恶性肿瘤的临床治疗上取得了显著效果,然而还是存在大部分患者对于免
随笔分类 - TCGA(The Cancer Genome Atlas) < 2024年10月 > 日一二三四五六 29 30 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 1 2 3 4 5 6 7 8 9 昵称: 风中之铃 园龄: 7年5个月 粉丝: 24 关注: 6 +加关注 ...
肿瘤基因组计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA) 通过TCGA计划,全球科学家希望协力逐一解开所有癌症的秘密,进而建立一个共享数据库。TCGA的主要研究目的是发现用于解码肿瘤细胞的分子结构所需的信息和技术工具,并增强人类对癌症遗传基础的认识。通过基因组分析技术,包括大规模的基因测序技术的应用,全面致力于癌症分子遗传基...
来自癌症基因组图谱研究网络(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人员针对甲状腺癌(thyroid cancer)进行了综合分析,鉴别出了一些侵袭性肿瘤的标记物,这有可能为给予个别患者适当的治疗方法提供了更好的靶点。 研究结果表明,有可能可以基于一些遗传标记物将这一疾病进行重新分类,推动甲状腺癌更多地受益...
TCGAThe Cancer Genome Atlas ProjectJanuary 24, 2008TCGAProgram• Goal: find genomic alterations that cause cancer (mutations, CNA, me..