gitclonehttps://github.com/BGI-Qingdao/TGS-GapCloser.git YOUR-INSTALL-DIR #minimap2的配置参照官网 #建议移除包带的minimap2,为已有的minimap2创建软链接rm-rf /home/liuxin/tgsgapcloser/minimap2 conda install -c bioconda minimap2ln-s /home/liuxin/miniconda3/bin/minimap2 /home/liuxin/tgsgapcloser/mi...
基因组组装过程中会得到草图的scaffold,需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。 1. 安装 下载 git clone https://github.com/BGI-Qingdao/TGS-GapCloser.git 如果已经安装了minimap2软件,在此次软链接一下软件地址 rm -rf TGS-...