conda install -c bioconda minimap2ln-s /home/liuxin/miniconda3/bin/minimap2 /home/liuxin/tgsgapcloser/minimap2/ #进入安装目录,完成编译 cdYOUR-INSTALL-DIR make #此处进入到准备好数据的工作目录下,使用绝对路径运行TGS-GapCloser.sh nohup/home/liuxin/tgsgapcloser/TGS-GapCloser.sh --scaff Cbp.LG.fast...
TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。 1. 安装 下载 git clone https://github.com/BGI-Qingdao/TGS-GapCloser.git 如果已经安装了minimap2软件,在此次软链接一下软件地址 rm -rf TGS-GapCloser/minimap2 ln -s MINIMAP2所在文件夹 TGS-GapCloser/ ...