conda install -c bioconda tgsgapcloser #测试,显示manual即为安装成功 tgsgapcloser -h 二、查看使用说明 以下参数说明相当清楚,看Example时有不懂可以参考下表。需要注意的是,默认是使用ONT reads,若是使用PacBio reads,需要使用--tgstype pb显式声明。 INFO : Run tgsgapcloser from /home/liuxin/miniconda3/e...
TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。 基因组组装过程中会得到草图的scaffold,需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。 1. 安装 下载 git clone https://github.com/B...