我的python安装在D盘,所以python.exe的路径就好设置了: 构建配体-受体-TF-mRNA多层网络: #计算配体-受体-TF-mRNA多层网络netList<- RunMLnet(sample@assays$RNA,"cellType.txt", RecClu, LigClu,pval, logfc)#可视化DrawMLnet(netList,LigClu,RecClu,workdir,PyHome,plotMLnet = T) 当然以上是单独两个细胞...
scMLnet 包 使用单细胞测序数据推断细胞通讯中的“配体-受体-TF-mRNA”调控网络(单细胞多层网络) oceanandshore关注IP属地: 北京 2023.08.25 20:50:44字数42阅读198 https://it.sohu.com/a/578737572_121124540 https://www.jianshu.com/p/648553a90443 https://www.jianshu.com/p/9611bd2867be...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 任意miRNA可以与任意的mRNA的3'UTR区结合么 miRNA对植物和动物的mRNA...
绿色圆形表示TF,菱形表示miRNA 7. 合并TF-miRNA调控关系及miRNA-mRNA作用关系来构建miRNA调控网络。 图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved...
networkanalyst使用|预测TF-gene,TF-miRNA,disease-chemical等相互作用网络并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 5079 0 12:01 构建TF-mRNA-miRNA调控网络(利用TRRUST和Mirwalk网站)并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 8793 1 14:01 10.疾病-通路-靶点-成分-药物网络构建(Cytoscape) 药学生阿程 10.7万 135 1:46...
火星居民身份证创建的收藏夹默认收藏夹内容:构建TF-mRNA-miRNA调控网络(利用TRRUST和Mirwalk网站)并用Cytoscape作图,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
系统性红斑狼疮患者的免疫浸润特征及其mRNA-TF-miRNA免疫调控网络的建立摘要: 系统性红斑狼疮(SLE)是一种自身免疫性疾病,其发生与多个免疫细胞的异常激活有关。本研究旨在探究SLE患者免疫细胞浸润的特征以及构建其mRNA-TF-miRNA调控网络。我们从GeneExpressionOmnibus(GEO)中获取了SLE患者和正常对照组的外周血样本,并通过...
scMLnet不仅可以模拟细胞间通信,还可以模拟细胞内基因调控网络。其基于细胞类型特异性基因表达、先验网络信息和统计推断,整合了细胞间通路(配体-受体相互作用)和细胞内子网络(受体-TF 通路和 TF-靶基因相互作用)。这意味着,scMLnet 可用于使用 scRNA-seq 数据预测细胞内基因表达的微环境调节因子,并了解细胞间通讯的...
绿色圆形表示TF,菱形表示miRNA 7. 合并TF-miRNA调控关系及miRNA-mRNA作用关系来构建miRNA调控网络。 图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved...
构建TF-mRNA-miRNA调控网络(利用TRRUST和Mirwalk网站)并用Cytoscape作图 亚卡达力biu 8440 1 08:20 如何使用Cytoscape做一个精美的ppi网络图(版本3.7.1) 黑眉锦蛇呀 1.6万 2 04:55 Cytoscape绘制成分靶点网络输入文件准备#精简教程 小L-Daily 9663 6 11:54 networkanalyst网站结合cytoscape软件构建gene...