通过多组学分析方法,包括临床生化检测、干扰素免疫库和病毒RNA PCR测试、质谱分析血浆蛋白质组和代谢组、血小板转录组和蛋白质组分析,以及scRNA测序与BCR/TCR-seq。研究结果发现Omicron感染后,血小板在抗病毒免疫中显示出增强的干扰素介导的抗病毒特征,而血清中的干扰素水平仍然较低;血小板倾向于与多种免疫细胞形成聚集体...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
表观生物正式上线免疫组库测序技术服务(TCR/BCR-seq),以T/B淋巴细胞为研究目标,以富集扩增决定BCR或TCR多样性的CDR区,再结合高通量测序技术,全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 技术流程 技术应用 图16. BCR(上)和TCR(下)的不同克隆扩增水平的百分比 参考文献 [1] Liu H, Pan ...
这可以帮助研究人员深入了解T细胞的异质性、可塑性,分析配对方式对TCR抗原特异性识别的影响,设计治疗性抗体等。 Takara单细胞TCR-Seq产品引入了更多的对照,在处理复杂样品时可以帮助获得更高质量的数据。辅以友好的数据分析软件,让新手也可以从容应对! 此外,我们还推出了基...
BCR分析发现了TLS特异的体细胞高频突变（SHM）和克隆扩增。图3. TLS区域的BCR克隆型的空间分布及突变频率 总结 鉴于各种肿瘤以及其它疾病已有大量的RNA-seq数据发表以及MiXCR和TRUST4等相关软件的开发和成熟，从RNA-seq数据挖掘BCR/TCR信息具有很高的可行性。此外，相对于成本更高以及公共数据更少的免疫组库测序，基于...
而且,它可以处理 RNA - seq 和 DNA - seq 数据,适用于各种实验设置,还能在统一的框架下分析 TCR 和 BCR 免疫库,并且具有先进的 V(D)J 组装算法,能够在存在测序错误的情况下准确识别克隆型,同时提供强大的可视化工具,方便研究人员进行后续分析。 TRUST4 则像是一个 “纠错大师”,它专门用于从 RNA - seq ...
Takara单细胞TCR-Seq产品引入了更多的对照,在处理复杂样品时可以帮助获得更高质量的数据。辅以友好的数据分析软件,让新手也可以从容应对! 此外,我们还推出了基于孔板的TCR&BCR测序建库方法: 新的TCR和BCR测序分析试剂盒了解下! - Takara (takarabiomed.com.cn)...
如在肿瘤相关研究中,过往大多研究都集中在TCR测序,而近年来的很多研究发现,肿瘤的发生变化和BCR反应也有相关性。所以同时TCR/BCR测序研究很有必要。 例如: Aizik等人采用B细胞受体高通量测序(BCR-Seq)来分析肿瘤浸润淋巴细胞B细胞(TIL-Bs)的抗体库特征,以及其在不同组织中的分布情况。数据表明抗体库特征是识别肿瘤...
幸运的是,现在有了单细胞TCR/BCR测序(scTCR/BCR-seq)技术,它就像是一个超级显微镜,能够深入观察每一个细胞的内部情况。这项技术不仅可以对TCR和BCR的配对链进行精准表征,还能同时获取细胞内常规的转录本信息。这样一来,我们就能更全面地了解免疫应答的机制和过程,分析细胞的表型和功能,从而更精准地应对各种免疫挑战...
图3. TLS区域的BCR克隆型的空间分布及突变频率 三、总结 鉴于各种肿瘤以及其它疾病已有大量的RNA-seq数据发表以及MiXCR和TRUST4等相关软件的开发和成熟,从RNA-seq数据挖掘BCR/TCR信息具有很高的可行性。此外,相对于成本更高以及公共数据更少的免疫组库测序,基于转录组测序的免疫组库分析在大样本队列研究方面具有更多优...