利用全长方法生成的单细胞RNA-seq数据提取T细胞库和异质性信息。来自scRNA-seq数据的全长(TCR)序列的组装允许alpha和beta链序列配对(在执行“bulk”分析时不可能),并允许clonality信息与单个T细胞的整个转录组集成。这种方法也呈现非琐碎的分析问题:规范化reference-based组装方法,依赖的一致性读到“参考”体细胞基因组...
结论 Jurkat(E621)细胞的TCRalpha和beta链基因、氨基酸序列和结构的确定,将为Jurkat做为效应T细胞、TCR重排模型等方面的研究提供基础。[关键词] Jurkat;T淋巴细胞受体;基因重排;免疫扫描型分析[中图分类号] R392.12 [文献标志码] ASequenceandstructureofthegeneΠaminoacidofJurkat(E621)TCRalphaandbetachainYAO...
包含twa.rda和twb.rda这两个列表数据,twa.rda和twb.rda分别包含4 个数据框,每个数据框10000行。每个数据框都是双胞中的一个样本降采样(downsampled,目的是生成缩略图)到10000最丰富的克隆型(alpha和beta链)的数据。 twa.rda的第一个数据框数据及解释: 1) Umi.count:barcodes的数量 2) Umi.proportion:barcode...
[5] Luo W, Ma L, Wen Q, Wang N, Zhou MQ, Wang XN. Analysis of the interindividual conservation of T cell receptor alpha- and beta-chain variable regions gene in the peripheral blood of patients with systemic lupus erythematosus. Clin Exp Immunol. 2008 Dec;154(3):316-24. doi: 10.1111...
8、In the TCR similarity graph, each node (clonotype) is connected by edges to its K nearest-neighbor (KNN) nodes based on TCR similarity as assessed by the TCRdist measure, which scores sequence similarity in the pMHC-contacting CDR loops of the TCR alpha and beta chains (here K is an...
5. P. Smelty, C. Marchal, R. Renard, L. Sinzelle, N. Pollet, D. Dunon, T. Jaffredo, J.-Y. Sire, J. S. Fellah, Identification of the pre-T-cell receptor alpha chain in nonmammalian vertebrates challenges the structure-function of the molecule.Proc Natl Acad Sci USA.107, 19991...
Basic informationSupplier Basic informationMore Product Name:TCR αβ/alpha-beta TCR Synonyms:TCR αβ/alpha-beta TCR CAS: MF: MW:0 EINECS: Mol File:Mol File Browse by Nationality Suppliers>China suppliers EnquiryRecommend You Select Member Companies...
Yang, D., et al. How does TCR-T cell therapy exhibit a superior anti-tumor efficacy. Biochemical and Biophysical Research Communications, 687, 149209 (2023). D. Flumens, et al. One-step CRISPR-Cas9-mediated knockout of native TCRalphabeta genes in human T cells using RNA electroporation,...
(2)目前PanPep只考虑了 TCR 的 CDR3 beta 链与肽的相互作用。近期的研究表明,其他链中的捕捉键可能在新抗原的 TCR 识别中发挥重要作用,因此预计未来建模会考虑更多信息,例如 HLA 类型和 alpha/beta 链。 (3)随着未来更多的 3D 晶体结构数据可用,直接使用 3D 数据构建模型将进一步提高肽-TCR 结合识别。
英文别名: TCR alpha + beta (Vb2) antibody [TCR-3]中文名: 中文别名: CBNumber: CB95759584 分子式: 分子量: 0 MOL File: Mol file 化学性质 安全信息 用途 供应商 7 TCR alpha + beta (Vb2) antibody [TCR-3]化学性质 安全信息TCR alpha + beta (Vb2) antibody [TCR-3]性质、用途与生产工艺 ...