Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术,该技术侧重于3’端的末端捕获,使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术,结合了SMART (SwitchingMechanismat 5’ End ofRNATemplate) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。 本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外...
这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2! SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及...
Company N测序数据downsample至100万个,而SMART-Seq Human BCR (with UMIs)的测序数据库均downsample至50万个。结果表明,SMART-Seq Human BCR (with UMIs)的重链 (HC) 和轻链 (LC) 分别生成约9.5K和22.9K的克隆型,远高于Company N方法所获得克隆型数量。(数据来源于Takara Bio USA, Inc.) 产品订购信息 Takar...
SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)兼容多种自动化液体工作站进行微缩化建库。比如使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在Mantis Liquid Handler (Formulatrix)上将反应体系体积微缩至1/2(HV),1/4(QV)以及在mosquito HV liquid handler (SPT Labs)上将反应体系体积微缩至1/8,均能获得与使用原反应体系高度一致的结果。
图2. 使用SMART-Seq Stranded Kit制备文库的结构特征 接头序列包含:通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列(P7以淡蓝色表示,P5以红色表示),用于区分单个lane上多个样本的Index序列(Index 1 [i 7] 序列连接在P7端,Index 2 [i 5]连接在P5端)。并且还包括识别测序引物区域的Read 2(紫色...
为解决上述既要、又要、还要的难题,获得高质量的全长RNA测序数据,Takara推出了SMART-Seq mRNA-Seq LP(with UMIs),简称为SSmRNA + UMIs。 与现有的其他单细胞测序技术相比,SSmRNA + UMIs具有以下优势特点: 01 既要——获得全长转录组信息 可以10 pg-100 ng的总RNA或1-1000个细胞起始,基于SMART技术(Switching...
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),所有样本都均一化至1.75M paired-end reads,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
TaKaRa子公司Clontech获得SMART-seq2技术专营权 TaKaRa Clontech Laboratories公司今日宣布该公司与路德维格癌症研究所签署了合作协议,成为路德维格癌症研究所SMART-seq2技术的独家供应商,该技术一般用于单细胞RNA测序。 SMART-seq2技术由路德维格癌症研究所理查德桑德伯格实验室与卡罗林斯卡医学院联合开发,并于...
为了比较SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)与其他同类试剂盒的性能,使用10 ng小鼠脾脏RNA制备BCR文库。N公司试剂盒测序reads downsample至1M reads。SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)的测序reads downsample至0.5M reads。结果显示,相同测序深度下,SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)检测到的BCR克隆型比N公司试剂盒多...
SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板,通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列(也就是模板转换步骤)。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo,每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode,用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称...