Company N测序数据downsample至100万个,而SMART-Seq Human BCR (with UMIs)的测序数据库均downsample至50万个。结果表明,SMART-Seq Human BCR (with UMIs)的重链 (HC) 和轻链 (LC) 分别生成约9.5K和22.9K的克隆型,远高于Company N方法所获得克隆型数量。(数据来源于Takara Bio USA, Inc.) 产品订购信息 Takar...
单细胞转录组研究对于研究细胞群内不同单细胞表达情况非常重要。Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术,该技术侧重于3’端的末端捕获,使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术,结合了SMART (SwitchingMechanismat 5’ End ofRNATemplate) 技术和LNA (Lock...
这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2! SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823)及...
SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)兼容多种自动化液体工作站进行微缩化建库。比如使用SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)在Mantis Liquid Handler(Formulatrix)上将反应体系体积微缩至1/2(HV),1/4(QV)以及在mosquito HV liquid handler(SPT Labs)上将反应体系体积微缩至1/8,均能获得与使用原反应体系结果高度一致的结果。...
图2. 使用SMART-Seq Stranded Kit制备文库的结构特征 接头序列包含:通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列(P7以淡蓝色表示,P5以红色表示),用于区分单个lane上多个样本的Index序列(Index 1 [i 7] 序列连接在P7端,Index 2 [i 5]连接在P5端)。并且还包括识别测序引物区域的Read 2(紫色...
在单细胞RNA-seq领域,Takara Bio提供的SMART技术,可以帮助研究人员进一步突破RNA-seq灵敏度上限,提供高质量的单细胞转录组分析结果。本次推荐的新品SMART-Seq mRNA LP (with UMIs),就是整合UMI的单细胞/微量样本的mRNA全长分析建库试剂盒。 单细胞转录组测序是指在单个细胞水平上,对转录组等遗传信息进行高通量测序...
The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2 图1. 与Smart-seq2法的比较 Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),所有样本都均一化至1.75M paired-end re...
TaKaRa子公司Clontech获得SMART-seq2技术专营权 TaKaRa Clontech Laboratories公司今日宣布该公司与路德维格癌症研究所签署了合作协议,成为路德维格癌症研究所SMART-seq2技术的独家供应商,该技术一般用于单细胞RNA测序。 SMART-seq2技术由路德维格癌症研究所理查德桑德伯格实验室与卡罗林斯卡医学院联合开发,并于...
SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)可以对稀有克隆型进行准确地检测 Takara科学家向10 ng 小鼠脾脏 RNA样本中掺入不同起始量的(100pg、10pg和1pg RNA)的10E8杂交瘤细胞系来源的RNA。使用SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)制备BCR文库,并在Illumina NextSeq上测序。测序reads downsample至3M reads。
Panel B.按列混合样品,这样每个pool中包含8个细胞,每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用,可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序(更多信息参见User Manual)。 图3. 96孔板中混合细胞群的分析。